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2. 转肽--肽键的形成(peptide bond formation) 在70S起始复合物形成过程中,核糖核蛋白体的P位上已结合了起始型甲酰蛋氨酸tRNA,当进位后,P位和A位上各结合了一个氨基酰tRNA,两个氨基酸之间在核糖体转肽酶作用下,P位上的氨基酸提供α-COOH基,与A位上的氨基酸的α-NH2形成肽键,从而使P位上的氨基酸连接到A位氨基酸的氨基上,这就是转肽。转肽后,在A位上形成了一个二肽酰tRNA。 3. 移位(Translocation) 转肽作用发生后,氨基酸都位于A位,P位上无负荷氨基酸的tRNA就此脱落,核蛋白体沿着mRNA向3端方向移动一组密码子,使得原来结合二肽酰tRNA的A位转变成了P位,而A位空出,可以接受下一个新的氨基酰tRNA进入,移位过程需要EF-G,GTP和Mg2+的参加。 多肽链延伸的终止 多肽链的最后一个肽键形成后,携带新合成多肽链的肽酰-tRNA从A位转移至P位,终止密码(UAA、UAG或UGA)进入A位,在正常的细胞中没有和终止信号互补的tRNA。 在E.Coli中,有三种释放因子RF-1、RF-2和RF-3(RF:Release Factor)能够识别终止密码。释放因子RF-1可以与UAA和UAG结合,而RF-2能与UAA和UGA结合,RF-3与RF-1或RF-2结合形成异二聚体,协助它们的作用。RF-3也结合GTP。 当异二聚体在A位与mRNA结合后,改变了肽酰转移酶的活性,使得该酶能够水解肽酰-tRNA酯。伴随着GTP的水解和释放因子从核糖体的解离,最后的多肽产物从核糖体释放出来。70S核糖体解离为30S和50S亚基,为合成另一个多肽分子作准备。 蛋白质合成是个耗能过程,生成氨酰-tRNA时虽说是消耗了一个ATP,但实际上是两个高能磷酸键水解,移位和延伸时又各消耗了一个 GTP,所以每形成一个肽键都需要4个高能磷酸键的水解。 参见p628 四、蛋白质前提的加工 多肽的修饰: (1) 切除N末端的甲酰-fMet ; (2)信号肽的切除 ; (3)部分肽段的切除 ; (4)个别氨基酸残基的修饰; (5)糖基或辅基的加入 ; 2.多肽链的折叠: (1)形成-S-S-键加速折叠 ; (2)分子伴侣(监护分子)帮助折叠; 五、信号肽序列指导蛋白质定位 在真核生物中,许多加工修饰过程都是发生在特定的细胞器中。例如蛋白质的糖基化就发生在内质网和高尔基体中。真核生物的蛋白质合成发生在细胞质中,所以需要将新合成的蛋白质向不同细胞器的转移,这个过程称为蛋白质运输或寻靶(targeting)。 定向于特定亚细胞区的蛋白质都带有特殊的位置信号,这个信号就象信封上的地址。用于蛋白质寻靶的分子信号是一段氨基酸序列,即信号肽。 (p629) 信号肽常用来特指指导蛋白质跨过内质网的信号,从更广泛的意义上讲,信号肽指的是指导蛋白质寻靶的任何一段连续的氨基酸序列。 使蛋白质定向于内质网的信号序列研究的最清楚。内质网信号肽的长度通常为10个氨基酸左右,大多数都是由疏水氨基酸残基组成,例如Leu, Val, Ile, Tyr,或Trp。典型的信号肽的N末端一侧含有一个带正电荷的氨基酸,例如Arg或Lys,而C末端一侧含有极性氨基酸或Ala。 作业(05-12-1) 一、简述tRNA二级结构的特点及其主要结构部分的功能。 答:tRNA的二级结构呈三叶草形,由四臂和四环组成:碱基配对部分称为臂,未配对部分称为环。主要结构部分的功能如下: 氨基酸臂:3’末端含有pCCA结构,功能为连接氨基酸; D环:含二氢尿嘧啶核苷酸残基,与氨甲酰- tRNA合成酶的结合有关; 反密码环:含反密码子,可与mRNA上的密码子相互识别; 可变环:大小有变化,是tRNA分类重要指标; TψC环:含有T、 ψ (假尿嘧啶核苷)和C残基的环。与核糖体的结合有关。 三叶草型结构特征: 氨基酸臂; D环:含二氢尿嘧啶核苷(dihydrouridine)酸残基; 反密码环:含反密码子; 可变环:大小有变化,是tRNA分类重要指标; TψC环:含有T、 ψ (假尿嘧啶核苷)和C残基的环。 二、参加原核生物DNA复制的酶有:①DNA聚合酶III;②解链酶;③ DNA聚合酶I; ④RNA聚合酶;⑤DNA连接酶。其作用顺序是: A. ④、③、①、②、⑤; B. ②、③、④、①、⑤; C. ④、②、①、⑤、③; D. ④、②、①、③、⑤; E. ②、④、①、③、⑤; * 第九章 蛋白质的生物合成 蛋白质的生物合成-翻译(transla
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