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第九章:蛋白质分子互相作用(5学时)
第一节:蛋白质分子互相作用(pp330-337)
例如:
抗原 + 抗体 → 免疫反应;
肌球蛋白 + 肌动蛋白 → 肌肉收缩;
多肽激素 + 膜受体 → 生理效应;
蛋白质抑制剂 + 酶 → 抑制酶活性;
分子间作用:分子聚合、分子杂交、分子识别、分子自我装配、多酶复合体。
分子和亚基的聚合(pp331-333)
部分蛋白质在溶液中,分子或亚基能够聚合成各种聚合体:
1. 例如:胰岛素(Ins):
Ins ( Ins2 (二聚体)
2Ins2 ( Ins4 (四聚体)
3Ins2 ( Ins6 (六聚体)
nIns2 ( Insn n6 (高聚体)
单体形成二聚体的主要结合力:
疏水作用:由B链上的Val12, Tyr16, Phe24, Phe25, Tyr26的疏水侧链形成一个疏水面;由两个单体的疏水面结合,形成一个疏水核;
氢键:两个单体的B链的C末端之间可以形成四个氢键(Phe24=Tyr26;Tyr26=Phe24),结果形成一个反平行β―折叠片。
聚合体的不同形状(332页 图9-1):
线性聚合体:线性聚合体有两个特点:a聚合体呈线形;b聚合度非常大。
环状聚合体:聚合体呈环状,有环对称性。如:C2二聚体、C3三聚体、C4四聚体、C5五聚体(231页 图6-40)。
螺旋聚合体:聚合体呈螺旋状,有各种形式,例如:
a 大肠杆菌的鞭毛:是单股非整数螺旋(332页 图9-1B);
b 烟草花叶病毒壳体蛋白:也是单股非整数螺旋(332页 图9-1E);
c 细菌鞭毛:五股整数螺旋(332页 图9-1D);
d 肌肉的F-肌动蛋白:双股螺旋(332页 图9-1C)
球状聚合体:聚合体呈空心球体(332页 图9-2)
相嵌互补的构象变化:
蛋白质分子或亚基之间的聚合不是任意的,其聚合部位必须能相嵌互补。有时为了满足相嵌互补,还要引起某种程度的构象变化(333页 图9-3)。
聚合体与生理功能:
许多蛋白质分子的聚合与解聚是与生理功能有关的。例如,鸡肝乙酰辅酶A羧化酶:单体无催化活性。加入磷酸,可以引起聚合,生成有催化活性的多聚体;去除活化剂,则又引起解聚,酶又失去活性。
分子杂交(pp333-334,molecular hybridization)
概念:分子杂交(molecular hybridization)有两种含义,一种是关于核酸分子的;一种是关于蛋白质分子的。
关于核酸分子的:指一条DNA链或者RNA链与另一条互补的核苷酸序列退火形成双链的过程。两条互补链之间的杂交遵守碱基配对的规则,即G≡C配对和A=T配对,它们分别由3个氢键和2个氢键相连接。
关于蛋白质分子的:指某些功能相同,种属来源(一级结构)不同的亚基,发生亚基之间的交叉聚合,形成有四级结构的,有活性的杂交酶分子的过程(本章所说的是指第二种含义)。
例子:乳酸脱氢酶(334页 图9-4)
分子杂交的结果:
两种纯聚体: LDH1(B4)、 LDH5(A4);
三种杂交分子: LDH2(B3A)、 LDH3(B2A2)、 LDH3(BA3)。
分子识别(pp334-334,molecular recognization)
概念:指生物大分子之间的专一性和特异性的作用或结合现象。例如:抗原与抗体的专一性结合,激素、植物凝集素、药物与受体的专一性结合,底物与蛋白酶的专一性结合等等。分子识别是通过两种生物大分子各自的结合部位来实现的。
分子识别的条件:
结合部位构象的嵌合互补:这样可以造成相当大的接触面积;
结合部位有足够的结合力:这样才能使两个大分子能够结合成为一体。
分子自我装配(pp334-335)
概念:指的是,有些细胞器(如核糖体、细菌鞭毛)、细胞器碎片(如腺粒体碎片)、以及病毒(如烟草花叶病毒),在拆散成蛋白质、核酸、糖以及其它低级组分之后,在特定的条件下,又能自动装配成具有原来生物功能的细胞器、细胞碎片以及病毒,这种过程称为自我装配。自我装配的基础是生物大分子之间互相识别、互相作用,是一种特殊的聚合现象。
例子:烟草花叶病毒(TMV)
TMV的结构:TMV是一个长300 nm、直径为18 nm的杆状颗粒。颗粒的中央是一个螺旋形的RNA分子,外壳是一个含有2130个相同亚基的外壳蛋白分子。这些亚基按照一定方式聚合成为一个螺旋状的多聚体。
自我装配的特性:用浓乙酸可以将TMV颗粒拆开成为RNA和外壳蛋白质亚基。如果再将它们混合在一起,在合适的条件下,它们能够自动重新装配成具有生物活性的TMV颗粒。TMV的自我装配是复杂的过程,具有许多中间步骤。
无RNA时的自我装配(见335页 图9-5):
在不同的pH值和离子强度下,TMA亚基可以聚合成为两种不同形状的管状聚合体
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