我考上交的生化笔记.doc

第一章 蛋白质的结构与功能 1.氨基酸的分类 非极性脂肪族氨基酸 脯缬异亮亮丙甘 谱写一两个丙肝患者 极性中性氨基酸 丝半胱甲硫苏 天冬酰胺谷氨酰胺 必须氨基酸 缬异亮亮苯丙蛋色苏赖 写一两本淡色书来 酸性氨基酸 天冬谷氨酸 碱性氨基酸 赖精组 捡来精读 支链氨基酸 异亮亮缬 一两只鞋 芳香族氨基酸 苯丙酪色 Ben丙是老色鬼 一碳单位 丝色组甘 施舍一根竹竿 含硫氨基酸 半胱胱蛋 一帮光蛋 生酮氨基酸 亮赖 同样来 生酮兼生糖氨基酸 异亮苯酪色苏 一本落色书 赖氨酸 含有两个氨基 谷氨酸天冬氨酸 含有两个羧基 脯氨酸羟脯氨酸焦谷氨基酸 亚基氨基酸 脯氨酸 容易使肽链走向形成折角的氨基酸 同型半胱氨酸 天然蛋白质中不存在的氨基酸 瓜氨酸 不出现在蛋白质的氨基酸 色氨酸酪氨酸 在 甘氨酸 除甘氨酸外都属于 苯丙氨酸、异亮氨酸 含有疏水侧链的氨基酸 甘氨酸 天冬氨酸天冬酰胺 丙氨酸 谷氨酸谷氨酰胺 缬氨酸 苏氨酸 异亮氨酸亮氨酸 苯丙氨酸 脯氨酸 色氨酸 丝氨酸 酪氨酸 半胱氨酸 赖氨酸 蛋氨酸 精氨酸 组氨酸 4.氨基酸及蛋白质的理化性质 氨基酸 蛋白质 PhpI，解离成阳离子；②若溶解PhPi，解离成阴离子 ①若溶液PhpI，蛋白质带正电荷；②若溶解PhPi，蛋白质带负电荷 等电点 PI=5.0 色氨酸酪氨酸（含有共轭双建）的最大吸收峰在280nm处，用于测定蛋白质含量 同左 茚三酮反应紫蓝色化合物最大吸收峰在 同左 双缩脲反应无 双缩脲反应阳检测蛋白质水解程度 胶体性质变性沉淀凝固 胶体性质变性沉淀凝固 Ps：核酸的嘌呤环和嘧啶环的最大吸收峰在—促肾上腺皮质激素—多肽 50个氨基酸残基以上的为蛋白质：51个氨基酸残基—胰岛素—蛋白质 6. 蛋白质的分子结构 一级结构 二级结构 三级结构 四级结构 定义 从 蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构 整条肽链所有原子 蛋白质分子中各 表现形式 肽链 Α螺旋β折叠β转角无规则卷曲 结构域分子伴侣 亚基 维系键 肽键二硫键 氢键 氢键离子键疏水键范德华力 氢键离子键 特点及意义 牛胰岛素有三个二硫键空间构象的基础 模体锌指结构钙结合蛋白亮氨酸拉链 举例肌红蛋白分子伴侣热休克蛋白 举例血红蛋白 7.蛋白质各级结构的特点 二级结构 2.α螺旋为右手螺旋，每3.6个氨基酸上升一圈，螺距为0.54nm，每周3.6个氨基酸残基；所有氨基酸均 可参加α螺旋，以Ala、Glu、Leu、Met多见 3.β转角以4个氨基酸残基组成，第二位残基为脯氨酸，其他有甘、色、天冬氨酸、天冬酰胺 4.模体是具有特殊功能的超二级结构；锌指结构是特殊的模体：由1个α螺旋和2个反相平行的β折叠组成，Zn+稳定作用，含锌指结构的蛋白质都能与DNA或RNA结合 三级结构 2.分子伴侣：提供环境加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。许多分子伴侣是ATP酶， 四级结构 单独的亚基没有生物学功能 A.蛋白质变性后：蛋白质空间结构破坏而一级结构不变可恢复其空间结构恢复功能B一级结构相似具有相似功能：催产素和抗利尿激素。 C氨基酸序列提供生物进化的信息 D重要蛋白质氨基酸序列改变可引起分子病：血红蛋白β亚基第6位谷氨酸-缬氨酸，导致镰刀形贫血 A一级结构师空间构象的基础，如空间结构遭破坏的核糖核酸酶只要一级结构未被破坏，就能恢复原来的空间结构，恢复功能。 B一级结构相似的蛋白质具有相似的高级结构与功能，如不同哺乳类动物的胰岛素都是由A和B两条链组成的，且二硫键的配对位置和空间构象也饿相似，一级结构中只有个别结构有差异，它们都执行相同的调节糖代谢的生理功能。 C一级结构氨基酸序列提供重要的生物进化信息，如人与猕猴的Cyt c一级结构很相近，人与黑猩猩的Cyt c完全相同，灰鲸是哺乳动物，由陆地动物演化，它与猪牛羊Cyt c一级结构相近。 D一级结构重要蛋白质的氨基酸序列改变可能引起疾病，如正常人血红蛋白β亚基的第6位氨基酸是谷氨酸，镰状红细胞贫血患者的血红蛋白中谷氨酸变成了缬氨酸，导致分子病。 蛋白质高级结构A.肌红蛋白和血红蛋白结构相似：都含有血红素为辅基。 肌红蛋白为三级结构 血红蛋白为四级结构：1分子Hb携带4分子氧气，胚胎期α2ε2，胎儿期α2γ2，成人α2β2 B.一级结构不变，蛋白质构象改变为构象病：疯牛病有朊病毒引起，α螺旋—β折叠 β折叠的蛋白对蛋白酶不敏感，水溶性差，热稳定性好，形成淀粉样纤维沉积而致病 9.蛋白质变性、沉淀和凝固 A变性：蛋白质空间结构破坏，一级结构不变，二硫键和非共价键的破坏 B复性：去除变性因素和恢复空间构象和功能