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枇杷种质资源ISSR反应体系的优化.pdf
枇杷种质资源ISSR反应体系的优化
吴锦程1杨向晖2林顺权2
(1福建省莆田学院环境与生命科学系福建莆田351100;2华南农业大学园艺学
院广州510642)
sequencerepeats,简单重复序列中间区域)扩增多态性是由
ISSR(inter-simple
Zietldewicz等创建的一种新型的微卫星类分子标记技术。采用真核生物广泛存在简
单重复序列(simple
反向排列的间隔不大的重复序列间的基因组片段,通常在引物的5’或37末端加
几个非重复的锚定碱基以保证引物与基因组DNA中SSR的57或37末端结合。
ISSR通常为显性标记,具有较高的稳定性和多态性,DNA用量少,技术要求不高,
成本低廉,且扩增时退火温度比较高保证了PCR扩增的可重复性。真核生物富含
SSR且变异快。因此ISSR标记技术可以检测基因组多位点的差异,在果树上已显
示出巨大的应用潜力。目前,枇杷上尚未见利用ISSR的报道。
要得到重复性好、条带清晰的ISSR扩增式样,往往易受诸多因素的影响而未
能成功,如引物与dNTPs用量、MgCl2的浓度等都会影响扩增式样。因此对ISSR
体系的优化显得十分重要,本实验对枇杷ISSR反应体系的优化进行研究以期为枇
杷种质资源的分子生物学研究提供技术支持。
采用CTAB一蛋白酶K法提取了枇杷种质的DNA,以835引物,以西班牙枇
杷品种Ullera为模板,对枇杷种质ISSR反应体系进行优化研究,结果表明:250L
反应体系中,Taq
适宜浓度或用量分别是:M92+为3.0mmol/L,TaqDNA聚合酶为1.2U,引物为
利、西班牙、日本、阿尔及利亚和中国的48份枇杷种质进行ISSR扩增,经琼脂糖
电泳获得了清晰的扩增图谱(图1,图2)。
67
图1引物835在48份枇杷种质中的ISSR扩增式样
(14)Marc(15)Ullera(16)Crisanto
荣本(22)大红袍(23)夹脚(24)硬条白砂
图2引物1135在48份枇杷种质中的ISSR扩增式样
(48)晚钟
山里本(45)茂木(46)梅花霞(47)香钟11号
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