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八基因重组和转座
第 8 章 基因重组和转座 2.同源重组的分子模型——Holliday模型 此模型中,同源重组主要有4个关键步骤 : ①两个同源染色体DNA排列整齐 ②一个DNA的一条链断裂、并与另一个DNA对应的链连接,形成Holliday中间体 ③通过分支移动产生异源双链DNA ④Holliday中间体切开并修复,形成两个双链重组体DNA,分别为: 二、同源重组的酶学机制 第二节 位点特异性重组 第三节 转座 一、原核生物转座子类型 三、真核生物转座子 λ噬菌体的生活史 溶菌生长途径 (lysis pathway) 溶源菌生长途径 (lysogenic pathway) 例: 位点特异性重组广泛存在于各类细胞中,起着十分特殊的作用,彼此有很大的不同。它们的作用包括某些基因表达的调节,发育过程中程序性DNA重排,以及有些病毒和质粒DNA复制循环过程中发生的整合与切除等。 此过程往往发生在一个特定的短的(20~200 bp)DNA序列内(重组位点),并且有特异的酶(重组酶)和辅助因子对其识别和作用。 特异位点重组的结果决定于重组位点的位置和方向。 如果重组位点以相反方向存在于同一DNA分子上,重组结果发生倒位。 重组位点以相同方向存在于同一DNA分子上,重组发生切除; 在不同分子上,重组发生整合。 特异位点重组的结果依赖于重组位点的位置和方向。重组位点以白箭头表示。A重组位点反方向位于同一DNA分子,重组结果发生倒位。B重组位点同方向位于同一DNA分子,重组发生切除;位于不同分子,重组发生整合 位点专一性重组最早是在λ噬菌体的遗传学研究中发现的。 λDNA通过重组整合到大肠杆菌染色体的专一性位点上,转变成为原噬菌体DNA的非活性状态。 一般位点专一性重组都具有λ整合作用的两个基本特征:①交换是相互的和保存原先的DNA,是典型的保守性重组(conservative recombination);②它发生在噬菌体和细菌DNA短同源序列中的专一性核苷酸上。 一、λ噬菌体的整合与切除 λ噬菌体侵入大肠杆菌细胞后,面临着裂解生长还是溶源生长两种生活型的选择,其DNA在不同生活型之间的转换包括两种状态:进入溶源状态需要λDNA整合(integrate)进宿主DNA,噬菌体DNA是细菌染色体的整合部分;由溶源状态进入裂解状态需要λDNA从宿主DNA上切除(excise)下来,λDNA在宿主细菌中 以环状分子独立存在。 这里,整合和切除均通过细菌DNA和λDNA上特定位点之间的重组而实现。这些特定位点叫附着位点(attachment site或att)。 细菌的附着位点称attB,由序列B、O和B’组成,噬菌体的附着位点称attP,由序列P、O和P’组成。其中B、B’、P、P’的序列各不相同,而O序列是attB和attP所共有的,说明在这些位点处发生的重组反应。 整合 BOB’ λ噬菌体的位点专一性重组 Int 切除 Xis IHF POB’ attR BOP’ attL 原噬菌体DNA Int IHF 细菌DNA 噬菌体DNA attB attP POP’ + 由于噬菌体DNA是环状的,在重组过程中,它以线性形式插入细菌染色体中,此时原噬菌体被重组产生的两个新att位点所固定。所以,形成这两个新的附着位点attL(BOP’)和attR(POB’)是很重要的,这样可以使整合和切除反应不在一对相同的反应序列之间发生。整合过程要求在attB和attP之间进行识别,而切除过程则在attL和attR之间识别。 因此,位点专一性重组反应的定向特征取决于重组位点的识别。尽管重组反应是可逆的,但反应导向则由不同条件决定,这是噬菌体生活过程的重要特征,因为它保证了整合反应不会立即被切除反应所逆转。反之亦然。 二、位点特异性重组的分子机制 转座因子(transposable element)是一种可以由染色体的一个位置转移到另外位置的遗传因子,也就是一段可以发生转座(transposition)的DNA,又称为转座子(transposon)。 转座的位置通常或多或少是随机的。当转座子插入一个基因内时,该基因即失活,如果是重要的基因就可能导致细胞死亡。因此转座必须受到控制,并且频率都很低。 转座子对基因组而言是一个不稳定因素,它可导致宿主序列删除、倒位或
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