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烟大生化
在大肠杆菌中由RuvA,RuvB和RuvC蛋白参与的同源重组。 (a) RuvA四聚体的图解。四个亚基形成的结构像四个花瓣的花。 (b) RuvA/RuvB的作用: (左)RuvA四聚体结合到Holliday位点; (中)RuvB六聚体结合到杂合双螺旋的两对面,DNA穿过其中心, RuvB六聚体的作用像马达,促进超螺旋分叉点通过复合体移动。 (右)RuvC结合到Holliday位点,由其核酸酶活性切断核酸链,切割位点由剪切体辨认。 (c) RuvA四聚体的电荷分布,蓝色表示正电荷,红色表示负电荷,注意正电荷位于四聚体的表面,有四个负电荷区域位于其中心。 (d) 假设的RuvA四聚体与Holliday位点结合的结构模型。 三、特异位点重组 原核生物中,有时基因重组依赖于小范围的同源序列的联会,重组只限于该小范围内,只涉及特定位点的同源区,这类重组称作~ 由整合酶催化,在两个DNA序列的特异位点间发生的整合 1、λ噬菌体DNA的整合与切除 ?噬菌体的整合酶识别噬菌体DNA和宿主染色体的特异靶位点,而后发生的选择性整合 通过attP和attB间的相互重组,环状的噬菌体DNA转换为整合的原噬菌体,原噬菌体通过attL和attR间的相互重组而切除 2、细菌的特异位点重组 沙门氏菌两种鞭毛蛋白表达的调控 3、免疫球蛋白基因的重组 IgG的分子结构 (1) (2) (3) (4) (5) 重组位点有7和9nt的信号序列,中间间隔12或23bp。 免疫球蛋白基因重组的模型 重组酶(RAC1/RAC2)复合体与重组信号序列结合 复合体使编码序列与重组信号序列之间的双连断裂,编码序列的末端形成发夹结构。 重组信号序列结合形成环状结构。 编码序列连接前经过加工,连接位点不十分确定,增加了免疫球蛋白的多样性。 DNA依赖性蛋白激酶(DNA-PK)和DNA连接酶参与了加工和连接过程。 9碱基序列 7碱基序列 在不同的核苷酸位点重组可以生成不同的蛋白质 四、转座重组(transposition) McClintock的重要发现 1950,麦克林托克,玉米籽粒颜色遗传,存在着一种转座因子(transposable elements)控制籽粒颜色,这些因子可在染色体上移动,控制着某些基因表达 70年代,夏皮罗(Shapiro),E. coli乳糖操纵子突变株,进行杂交分析,确认转座子的存在。 存在于染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位称为转座子 大多数基因在基因组内的位置是固定的 有些基因可以从一个位置移动到另一位置 可移动的 DNA序列包括插入序列和转座子 由插入序列和转座子介导的基因移位或重排称为~ 转座子移位:导致DNA链的断裂/重接 or某些基因启动/关闭。 引起:a.插入突变; b.产生新的基因; c.染色体畸变; d.生物进化,遗传效应。 转座子:原、真核细胞 与同源染色体重组相比,转座子作用频率低得多,构建突变体有重要意义 插入序列转座 插入序列(insertion sequences,IS):750~1500bp 反向重复序列:9~41bp,位于两侧 转座酶编码基因:产物引起转座,位于中间 正向重复序列:4~12bp,位于反向重复序列外侧 插入序列特有 组成: 保守性转座:从原位迁至新位 复制性转座:插入序列复制后,一个复制本迁到新 位,另一个保留在原位 方式 转座子转座 转座子(transposons): 可从一个染色体位点转移到另一位点的分散重复序列 组成 反向重复序列 转座酶基因 特殊基因:如抗生素抗性基因等 转座子具有反向末端重复序列以及在靶部位两侧产生的同向重复序列。在该例中靶序列为5bp,转座子末端由9bp反向重复序列组成,数字1-9指序列重复碱基对。 *两侧正向重复 * **末端反向重复 ** (一) 细菌的转座因子 1.插入因子 2.组合型转座子:两个插入序列之间夹着一段序列(如抗性基因)。两个插入序列可以同向或反向排列,有时均有转座活性,有时只有一个有转座活性。 3.复合型转座子:插入序列被转座酶基因取代,图示为Tn3(TnA家族)的结构。两端为38bp的反向重复,其两侧为5bp的靶序列,tnpA编码转座酶,tnpR编码的蛋白质可以作为解离酶(使转座子与受体DNA形成的共整合体重组和解离),也可以作为阻遏蛋白调节tnpA和tnpR两个基因的表达,res为解离的控制位点,TnpR蛋白结合于其上发挥调控作用。 4.转座的方式 转座子可用不同的方式转座,转座因子插入
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