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植物病原细菌的分离
植物病原细菌的分离、纯化及鉴定
1实验目的及意义
植物病原菌的分离、鉴定是植物病理学实验最基本的操作技术之一,通过本实验,要求掌握植物病原菌分离培养、纯化鉴定的一般原则和方法。
2实验材料及准备
2.1 实验材料:新发病的植物组织
2.2 培养基准备(LB培养基):胰蛋白胨1%,NaCl 1%,酵母浸粉0.5%,pH7.0-7.2,121℃灭菌20 min,备用。
2.3 实验用具:载玻片、盖玻片、酒精灯,手术剪,镊子,培养皿(Φ9cm),斜面培养基,灭菌水,1%,打火机。
3 实验方法及步骤
3.1 植物样品的采集
选取发病初期植株,样本尽量保持完整,至少包含病健交界处;将样品放入纸袋保存或邮寄,并做好记录;需要分离的标本应尽快完成分离工作(1-5d),长期保存需压干,未压干的标本勿装塑料袋。
3.2 发病组织的显微检查
准备好洁净的载玻片、盖玻片和水;取小的整块标本洗净、晾干/吸干;切取约2×4mm大小病健交界组织;从上述组织中切取尽可能薄的小片平放在载玻片上;加一滴水,盖好盖玻片,防止气泡;先用低倍镜(4×,10×)检查,看到白色、半透明、雾状的喷菌现象;换用40倍物镜观察,看到杆状、透明、活动的菌体,证明的确为细菌性病害。
3.3 病原物的分离和培养
选取镜检有喷菌现象的组织进行划线分离:所取组织用自来水洗净,吸干;(以下进入超净工作台操作)将植物组织剪成1×4mm的大小,1%的次氯酸钠消毒2-10min,灭菌水洗2-3次;将组织从病斑处剪碎放入约0.5-1ml水中,并让组织碎块在水中浸泡5-15min,让细菌释放到灭菌水中;取病汁液1-3环,在LB平板上划线。28℃温箱中培养,每天观察菌落生长情况并记录:菌落长出的时间、菌落大小、颜色、形态。
3.4 病原物的纯化和保存
3-4 d后选取生长量较多且形态一致的菌落,LB平板上划线纯化。若仍然生长不纯,则需多次纯化。划菌采用三线法。挑取纯化后的单菌落移入斜面生长,每菌移3管。24小时后从斜面上再次转移菌体,并且保存该病原菌。
3.5 病原物的鉴定
利用基因组提取试剂盒提取细菌基因组,用通用引物将细菌16S rDNA序列扩增出来,长度1.5k左右。
16S rNDA通用引物:U8-27(F)5’-AGAGTTTGA TC(AC)TGGCTCAG-3’;
L1494-1514(R)5’-CTACGG(AG)TACCTTGTTACGAC-3’
25ul的反应体系:Buffer 2.5 ul
Mg2+(25M) 3.75ul
dNTP 2ul
rTaq 0.5ul
primer1 0.6ul
primer2 0.6ul
DNA 1ul
ddH2O 14.05ul
Total 25ul
PCR反应条件:94℃ 5min
94℃ 1 min
56℃ 1min 30cycle
72℃ 2 min
72℃ 10 min
12℃ foever
将PCR产物送测序公司进行测序,然后将序列送至基因库中进行比对,同源性最高,且至少达到97%以上可认为是同一种。也可以将序列下载后用比对软件进行生物进化分析,可以看到与各菌种间亲缘关系。
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