基于遗传算法的猕猴桃的培苗变异的仿真精要.docx

程序设计报告 （利用遗传算法仿真猕猴桃组培苗变异） 学院： 专业： 姓名： 学号： 指导老师： 昆明理工大学 目录 一、绪论 1. 任务 -------------------------------------- 3 2. 对象 -------------------------------------- 3 3. 意义 -------------------------------------- 3 4. 技术路线 -------------------------------- 3 5. 遗传算法 -----------------------------------5 二、设计 1. 框架 --------------------------------------- 7 2. 程序流程图 ------------------------------- 7 3. 运行结果 ----------------------------------- 9 4. 分析总结 ----------------------------------- 11 三、软件著作权 1. 软件结构与开发环境----------------------11 2. 设计说明---------------------------------------12 3. 附录----------------------------------------------12 四、心得体会-----------------------------------------13 一、绪论 3 1、任务 3 2、对象 3 3、意义 4 4、技术路线 4 1、JDK的获取 4 2、JDK的安装及环境变量的配置 4 3、Eclipse的获取与安装 6 5、遗传算法 6 1、选择： 6 2、交叉 7 3、变异 7 4、终止条件 8 二、设计 9 1、框架 9 2、程序流程图 9 3、运行结果 10 4、分析总结 12 三、软件著作权 13 1、软件结构与开发环境 13 2、设计说明 13 3.附录 13 四、心得体会 15 一、绪论 1、任务 掌握JAVA语言环境的搭建，利用生物分子学内容，通过适应性函数等相关遗传算法对贝酵母SSUI基因的部分基因序列进行识别，筛选。最终观察分析结果，从适应度等角度得到变异前后的差别联系，得到最优基因。 2、对象 贝酵母SSUI基因的部分基因序列。 3、意义 基因识别是生物信息学的一个重要分支，使用生物学实验或计算机等手段识别DNA序列上的具有生物学特征的片段。基因识别的对象主要是蛋白质编码基因，也包括其他具有一定生物学功能的因子，如RNA基因和调控因子。基因识别是基因组研究的基础。利用JAVA程序的搭建，运用遗传算法对基因序列进行一代一代的变异遗传，然后对结果进行分析对比，得到最优基因。最优基因的个体具有较强的适应性，是最适合环境的生物个体。据此可以对遗传规律进行总结，对生物进行筛选。 4、技术路线 1、JDK的获取 从Oracle公司的网站上可以免费获取各种版本的JDK，Oracle公司的网址。注意这次设计实用的是JDK 1.7 2、JDK的安装及环境变量的配置 JDK有安装版和直接解压版。 安装版安装方法如下： （1）找到下载的安装包，双击运行。注意：如果是32位系统运行jdk-7u60-windows-i586.exe，64位操作系统运行jdk-7u60-windows-x64.exe。 （2）按照系统提示安装JDK，需注意的是再安装时安装路径尽量不要再C盘，并且安装路径不要包含空格和中文。 （3）环境变量配置 Windows XP：在桌面右击“我的电脑”，然后单击“属性”，在“系统属性”对话框中选择“高级”选项卡，然后单击“环境变量”按钮，打开“环境变量”对话框，找到“系统变量”中名为Path的行，单击编辑，将JDK中bin目录的安装路径加入到环境变量中。为了编程方便可以新建一个classpath的环境变量，并将JDK中lib目录的安装路径加入到该环境变量中。 Windows 7，windows 8，windows 8.1：在桌面右击“我的电脑”，然后单击“属性”，在“系统”对话框中选择“高级系统配置”，在打开的“系统属性”对话框中选择“高级”选项卡，然后单击“环境变量”按钮，打开“环境变量”对话框，找到“系统变量”中名为Path的行，单击编辑，将JDK中bin目录的安装路径加入到环境变量中。为了编程方便可以新建一个classpath的环境变量，并将JDK中lib目录的安装路径加入到该环境变量中。 3、Eclipse的获取与安装 Eclipse是IBM的开源项目，可以从Eclipse官方网站（ ）免费获取