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实验一 重复力的估算
一、实验目的
掌握与数量性状重复力有关的基本概念和基本计算方法。
重复力(repeatability)是衡量一个数量性状在同一个体多次度量值之间的相关程度的指标。导致个体多次重复度量值相关的原因,除了个体基因效应外,个体所处的持久性环境效应也将对性状的终身表现产生相同的影响。此外,一些暂时的或局部的特殊环境因素只对个体性状的某次度量值产生影响,这种效应称之为暂时性环境效应。当个体性状有多次度量时,这种暂时性环境效应对多次度量值的影响有大有小、有正有负,可以相互抵消一部分,从而可提高个体性状生产性能估计的准确性。
二、实验原理
从效应剖分来看,可以将环境效应(E)剖分为持久性环境效应()和暂时性环境效应()两个部分,即E=+,因此P=G+E=G++。假定基因型效应、永久性环境效应和暂时性环境效应之间都不存在相关,可以将表型方差()剖分为,因此重复力()可定义为:
可见,重复力实际上就是以个体多次度量值为组的组内相关系数,因而其估计方法与组内相关系数的计算完全一致。组内相关系数描述了组内有某种特定联系的多组数据两两之间的平均相关系数,如果是按个体分组,那么每组数据就是一个个体的各次度量值,与两变量简单相关系数计算一样,组内相关系数也是通过计算变量方差和协方差得到的。通过推导,组内相关系数等于组间方差()在总方差中占的比例,在方差分析中通常用组间方差和组内方差()之和代替总方差。因此,重复力通常是在按个体分组后的单因素方差分析基础上计算的,计算公式如下:
式中:为单因素方差分析中的组间均方;为单因方差分析中的组内均方;k为每个个体的度量次数。当个体度量次数不相等时,可按下式计算平均的有效量度次数():
三、实验方法及设备
本实验的计算方法是单因素方差分析,以EXCEL为平台演示个计算步骤,也可以用函数型计算器分步完成。
四、实验步骤
(1)实验数据:统计10头母猪各胎产仔数(表19-1)。
表19-1 某猪种10头母猪各胎产仔数
母猪号 胎数 1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 11 13 12 14 10 12 9 7 81 955 2 9 12 13 11 12 15 13 10 11 9 106 1274 3 10 12 14 9 15 11 10 12 8 93 1111 4 8 11 13 9 15 12 6 68 804 5 13 11 15 13 14 12 15 13 10 9 116 1518 6 9 0 14 13 14 9 12 7 81 967 7 14 11 13 12 15 13 12 15 12 9 117 1537 8 8 10 12 13 11 13 12 7 79 911 9 10 11 15 13 11 10 6 70 836 10 12 15 14 13 13 12 11 14 11 9 115 1485 合计 77 926 11398 (2)将母猪各胎产仔记录()按照表格形式录入EXCEL中,利用各种计算函数,计算所需要的中间结果:
用COUNT函数统计每头母猪的产仔记录数,如果上述数据的起始位置是B4,在K4位置键入“=COUNT(B4:J4)”,或用函数引擎导入,得到数字“7”,即为第一头母猪的产仔胎数记录,
类似地,在L4上键入“=SUM(B4:J4)”,得到数字“81”,统计第1头母猪的所有胎次的产仔数总和,。
类似地,在M4位置键入“=SUMSQ(B4:J4)”,得到数字“955”,统计第1头母猪的所有胎次的产仔数平方和,。
将K4、L4和M4的公式一并向下拷贝到每头母猪的记录后面,得到相应的计算结果。
在K14、L14和M14的位置,分别键入“=SUM(K4:K13)”, “=SUM(L4:L13)”和 “=SUM(M4:M13)”,得到相应的总和:。此外,在K15位置键入“=SUMSQ(K4:K13)“,得到。
(3)计算平方和、自由度、均方和。
上述计算中,可用EXCEL自动实现。
(4)列方差分析表(表19-2)
表19-2 方差分析表
变异来源 自由度 平方和 均方 期望均方 组间 组内 总和 (5)计算重复力
五、作业
根据表19-3资料计算绵羊毛长的重复力。
表19-3 某绵羊群2~5周岁毛长
羊号 2周岁 3周岁 4周岁 5周岁 羊号 2周岁 3周岁 4周岁 5周岁 1 9.0 8.0 8.5 9.5 11 8.0
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