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定量pcr方法和数据剖析.pptVIP

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定量pcr方法和数据剖析

定量PCR原理、应用及数据分析 ZJW Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 原理: PCR(多聚酶链式反应):一种体外扩增特异DNA片段的技术。反应分为变性(denaturation)、退火(annealing)、延伸(extension)三步。 PCR扩增理论方程: Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 起点定量与终点定量: 起点的DNA量为“天然”的含量,更有意义;终点的DNA量为经过PCR过程 “加工”的量,存在部分“失真”。(终点定量存在更大的误差) Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 定量PCR:通过实时监测PCR每一个循环扩增产物相对应的荧光信号,来实现对起始模板进行定量或者定性的分析 化学原理:荧光染料嵌合法, 探针法 SYBR Green I(不饱和型),Eva Green / LC Green(饱和型),与dsDNA小沟部位嵌合,具有绿色激发波长。游离时不发光。 缺点:需用melting curve检测产物特异性。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 探针法:可用于多重PCR及基因分型 TaqMan 探针:检测积累荧光 一种寡核苷酸探针, 探针两端各锚定一个基团,淬灭剂则在3‘末端。 Taqman探针识别并结合特定的靶序列; 探针完整时,报告基团R发出的荧光被淬灭基团Q吸收; 在进行延伸反应时,Taq聚合酶的 5’外切酶活性将探针切断, 使得荧光基团与淬灭剂分离,发射荧光。一分子的产物生成就伴随着一分子的荧光信号的产生。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 基线:扩增曲线中的水平部分 阈值(Threshold):指扩增曲线的指数增长区域内适当位置上设定的荧光检测界限。 Ct值:从基数到指数增长的拐点所对应的循环次数 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 定量PCR数学原理 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 定量PCR技术的应用 定性分析:病毒病原菌检测、生物品种鉴定、SNP分析等、基因突变分析等 绝对定量:基因拷贝数分析,病毒病原菌定量分析等 相对定量:mRNA表达分析,siRNA表达分析等 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 定量PCR实验流程 目标基因的查找、比对 引物、探针的设计与合成 反应体系和条件的优化 数据分析 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 定量PCR引物设计的要求: ① Tm=55-65℃ ② GC=30-80% ③ PCR 扩增产物长度:引物的产物大小不要太大,一般在 80-300bp 之间都可。 ④ 引物的退火温度要高,一般要在 60℃以上。 Evaluation only. Crea

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