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并行程序的编译和运行（二） MPI 编译环境配置和使用 1.1 基本编译器 曙光集群配置两套基本的编译器：1、PGI 编译器，2、GCC 编译器。它们 的编译命令如下： PGI C 编译器 pgcc C++编译器 pgCC Fortran 77 编译器 pgf77 Fortran 90 编译器 pgf90 GCC C 编译器 gcc C++编译器 g++ Fortran 77 编译器 g77 Fortran 90 编译器 gfortran 1.2 MPI 编译器 MPI 编译器实际上是 MPI 编译 MPI 程序所使用的编译命令。这些命令在执 行的过程中仍然调用 1.1 中的基本编译器命令，只是在多加了几个与 MPI 通信库 相关的连接参数而已。所以 MPI 既可以使用 PGI 作为编译器又可以使用 GCC 作 为编译器。 MPI 在设计之初考虑了在各种通信网络上工作的情况，由于曙光集群既存在 Infiniband 高速网络，又存在千兆以太网，所以系统为这两种通讯介质都编译了 对应的 MPI 版本。 综上所述，对于 Infiniband 高速网络，一共有 2 套 mpi 供用户使用： 通信网络 使用的基 本编译器 MPICH 路径 MVAPICH 体系 Infiniband 高速网络 GCC 和 PGI 编译 /cluster/soft/apps/mpi/mvapich/ v1.0/gcc.pgf90_x64 OpenMPI 体系 Infiniband 和千兆以 太网 GCC 和 PGI 编译 /cluster/soft/apps/mpi/openmpi/ v1.2.4/gcc.pgf90_x64 在编译和运行一个 mpi 程序的时候只能同时使用一个 MPI 版本，不能同时 混用多个。 系统默认情况的 MPI 采用 MVAPICH 体系的 mpi。 用户登录集群后，可以 通过命令$which mpicc 来查看，该命令的输出为 /cluster/soft/apps/mpi/mvapich/v1.0/gcc.pgf90_x64/bin/mpicc。 采用该命令编译后的 MPI 可执行程序，以 cpi.c 为例，编译和运行时的命令 格式如下： 编译前查看确认路径： $which mpicc /cluster/soft/apps/mpi/mvapich/v1.0/gcc.pgf90_x64/bin/mpicc 编译和运行之前查看当前使用的是哪一个 MPI 是一个好习惯，也是一个必 不可少的步骤，确认 MPI 路径没问题后，就可以使用了。 编译：$mpicc –O3 cpi.c –o cpi 生成的可执行程序名字为 cpi 运行前查看确认路径：$which mpirun /opt/vltmpi/OPENIB/mpi/bin/mpirun 确保 MPI 路径正确。 运行：$mpirun_rsh –ssh –hostfile ./ma –np 2 ./cpi 其中的 ma 是主机列表，内容如下： $cat ma node1 node1 node1 node1 关于 cpi 的运行结果在并行程序的编译和运行（一）里面已经介绍过，这里 不再赘述。 如果想采用 OpenMPI 该怎么办呢？ 方法很简单，用完整的路径编译和运行就可以了。 编译： $ /cluster/soft/apps/mpi/openmpi/v1.2.4/gcc.pgf90_x64/bin/mpicc –O3 cpi.c –o cpi.ompi 生成的可执行程序文件名字为 cpi.ompi 运行： $/cluster/soft/apps/mpi/openmpi/v1.2.4/gcc.pgf90_x64/bin/mpirun –mca btl openib –hostfile ./ma –np 2 ./cpi.ompi ma 文件的内容如下： node1 node1 有时候如果不方面使用完整路径，而又想使用 OpenMPI，可以设定默认的 PATH 路径为 OpenMPI 即可，方法如下： $export PATH=/cluster/soft/apps/mpi/openmpi/v1.2.4/gcc.pgf90_x64/bin:$PAT H 这时再执行 which mpicc，会发现这是的默认的 MPI 已经是 OpenMPI。 $which mpicc /cluster/soft/apps/mpi/openmpi/v1.2.4/gcc.pgf90_x64/bin/mpic