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综合性血液病分子诊断体系的建立和实践
刘红星 lhongxing@
陆道培血液?肿瘤中心 分子诊断室
我们一直在进步
更强的团队力量
更好的硬件支持
更多的新项目
优化的项目设置
血液病诊断和治疗已经进入分子生物学时代
第二代测序临床应用
定量PCR临床应用
定性PCR临床应用
基因组学的研究推动疾病分子标记的发现和临床应用
97.3%的AML患者携带其中一种或以上的基因突变
预后差:FLT3-ITD、MLL-PTD、ASXL1、PHF6
预后好:CEBPA、IDH2、NPM1伴IDH1/IDH2突变
伴DNMT3A、NPM1突变、MLL易位患者,采用大剂量的柔红霉素治疗可提高生存率
Prognostic Relevance of Integrated Genetic Profiling in Acute Myeloid Leukemia
Jay P. Patel, et al., N Engl J Med 2012;366:1079-89
肿瘤的突变组
每一个肿瘤的发生都是一个基因团伙在犯罪
每一个肿瘤基因组都是不同的基因突变的组合
白血病分子诊断
只根据一种融合基因分类的患者仍有异质性
AML1-ETO VS. AML1-ETO+KIT突变
只检测一种突变也是不够的
NPM1 VS. FLT3 VS. NPM1+FLT3
新的突变出现提前可能预示临床进展
急变、耐药等
对肿瘤突变组的全面了解有助于指导个性化治疗
分子诊断的发展趋势及挑战
Lucy A. Godley, DOI:0.1056/NEJMe1200409
分子诊断临床应用遇到的问题
临床医师如何认识新的项目?
实验室如果向临床医师推荐新的项目?
如何提高突变的检测灵敏度?
如何降低检测费用?提高发现分子标记的速度?
综合性血液病分子诊断体系
个体差异相关的药物代谢、药物不良反应等
其它项目:移植后嵌合状态;IG、TCR克隆性;BCR-ABL1变异分析等
孟德尔遗传病:先天性免疫缺陷、范可尼贫血等
“活在当下”与“追本溯源”
用初治时的石蜡、形态涂片标本进行基因突变筛查
从实验方案和流程设计上加快报告速度
新技术的应用和技术创新
融合基因和基因突变筛查 → 针对性监测
降低总体检测费用,争取宝贵时间
内容将不断增加,价格一般不再调整
综合性血液病分子诊断体系
高通量基因测序的应用
降低单位检测成本
肿瘤“突变组”分析变为可能
深度测序 – 突变MRD监测
IG、TCR免疫组库分析
白血病融合基因和基因突变检测
V2.3版31种融合基因筛查
新的融合基因筛查项目
AML融合基因筛查(13种)
AML1-EAP(1);AML1-ETO(1);AML1-MDS1(2);CBFB-MYH11(8);DEK-CAN(1);NPM-ALK(1);NPM-MLF1(1);NPM-RARA(2);PLZF-RARA(2);PML-RARA(5);SET-CAN(1);TEL-ABL1(2);TLS-ERG(5)
ALL融合基因筛查(10种)
BCR-ABL1(6);E2A-HLF(3);E2A-PBX1(2);NPM-ALK(1);NPM-MLF1(1);SET-CAN(1);SIL-TAL1(1);TEL-ABL1(2);TEL-AML1(2);TLS-ERG(5)
MPN融合基因筛查(23种)
AML1-MDS1(2);BCR-ABL1(6);FIP1L1-PDGFRA(5) ;TEL-ABL1(2);18种PDGFRB fusion gene;TLS-ERG(5)
MLL融合基因筛查(11种)
MLL-PTD;MLL-AF1p(4);MLL-AF1q(4);MLL-AF4(12);MLL-AF6(4);MLL-AF9(8);MLL-AF10(18);MLL-AF17(1);MLL-AFX(4);MLL-ELL(8);MLL-ENL(4)
融合基因筛查的特点和意义
从分子水平快速鉴定患者基因异常
节省时间和总体费用
大多数情况下,某一患者只有一种融合基因阳性
提供按WHO2008标准分类的依据
预后判断和指导用药
提供灵敏的MRD监测指标
病例:格列卫治疗FIP1L1-PDGFRA白血病
男,43岁,贫血,血小板低,嗜酸粒细胞增多
31种融合基因筛查:FIP1L1-PDGFRA阳性
格列卫每周200mg→每周100mg治疗
血象很快转为正常
FIP1L1-PDGFRA定量逐渐降低 32.56% 5.83% 0.0089%
基因突变筛查项目
AML基因突变筛查(11种)
CEBPA;DNMT3A;FLT3-ITD/TKD;IDH1;IDH2;KIT;KRAS;NPM1;NRAS;TE
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