1-刘红星-综合性血液病分子诊断体系-2幻灯片.pptx

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综合性血液病分子诊断体系 的建立和实践 刘红星 lhongxing@ 陆道培血液?肿瘤中心 分子诊断室 我们一直在进步 更强的团队力量 更好的硬件支持 更多的新项目 优化的项目设置 血液病诊断和治疗已经进入分子生物学时代 第二代测序临床应用 定量PCR临床应用 定性PCR临床应用 基因组学的研究推动疾病分子标记 的发现和临床应用 97.3%的AML患者携带其中一种或以上的基因突变 预后差:FLT3-ITD、MLL-PTD、ASXL1、PHF6 预后好:CEBPA、IDH2、NPM1伴IDH1/IDH2突变 伴DNMT3A、NPM1突变、MLL易位患者,采用大剂量的柔红霉素治疗可提高生存率 Prognostic Relevance of Integrated Genetic Profiling in Acute Myeloid Leukemia Jay P. Patel, et al., N Engl J Med 2012;366:1079-89 肿瘤的突变组 每一个肿瘤的发生都是一个基因团伙在犯罪 每一个肿瘤基因组都是不同的基因突变的组合 白血病分子诊断 只根据一种融合基因分类的患者仍有异质性 AML1-ETO VS. AML1-ETO+KIT突变 只检测一种突变也是不够的 NPM1 VS. FLT3 VS. NPM1+FLT3 新的突变出现提前可能预示临床进展 急变、耐药等 对肿瘤突变组的全面了解有助于指导个性化治疗 分子诊断的发展趋势及挑战 Lucy A. Godley, DOI:0.1056/NEJMe1200409 分子诊断临床应用遇到的问题 临床医师如何认识新的项目? 实验室如果向临床医师推荐新的项目? 如何提高突变的检测灵敏度? 如何降低检测费用?提高发现分子标记的速度? 综合性血液病分子诊断体系 个体差异相关的药物代谢、药物不良反应等 其它项目:移植后嵌合状态;IG、TCR克隆性;BCR-ABL1变异分析等 孟德尔遗传病:先天性免疫缺陷、范可尼贫血等 “活在当下”与“追本溯源” 用初治时的石蜡、形态涂片标本进行基因突变筛查 从实验方案和流程设计上加快报告速度 新技术的应用和技术创新 融合基因和基因突变筛查 → 针对性监测 降低总体检测费用,争取宝贵时间 内容将不断增加,价格一般不再调整 综合性血液病分子诊断体系 高通量基因测序的应用 降低单位检测成本 肿瘤“突变组”分析变为可能 深度测序 – 突变MRD监测 IG、TCR免疫组库分析 白血病融合基因和基因突变检测 V2.3版31种融合基因筛查 新的融合基因筛查项目 AML融合基因筛查(13种) AML1-EAP(1);AML1-ETO(1);AML1-MDS1(2);CBFB-MYH11(8);DEK-CAN(1);NPM-ALK(1);NPM-MLF1(1);NPM-RARA(2);PLZF-RARA(2);PML-RARA(5);SET-CAN(1);TEL-ABL1(2);TLS-ERG(5) ALL融合基因筛查(10种) BCR-ABL1(6);E2A-HLF(3);E2A-PBX1(2);NPM-ALK(1);NPM-MLF1(1);SET-CAN(1);SIL-TAL1(1);TEL-ABL1(2);TEL-AML1(2);TLS-ERG(5) MPN融合基因筛查(23种) AML1-MDS1(2);BCR-ABL1(6);FIP1L1-PDGFRA(5) ;TEL-ABL1(2);18种PDGFRB fusion gene;TLS-ERG(5) MLL融合基因筛查(11种) MLL-PTD;MLL-AF1p(4);MLL-AF1q(4);MLL-AF4(12);MLL-AF6(4);MLL-AF9(8);MLL-AF10(18);MLL-AF17(1);MLL-AFX(4);MLL-ELL(8);MLL-ENL(4) 融合基因筛查的特点和意义 从分子水平快速鉴定患者基因异常 节省时间和总体费用 大多数情况下,某一患者只有一种融合基因阳性 提供按WHO2008标准分类的依据 预后判断和指导用药 提供灵敏的MRD监测指标 病例:格列卫治疗FIP1L1-PDGFRA白血病 男,43岁,贫血,血小板低,嗜酸粒细胞增多 31种融合基因筛查:FIP1L1-PDGFRA阳性 格列卫每周200mg→每周100mg治疗 血象很快转为正常 FIP1L1-PDGFRA定量逐渐降低 32.56% 5.83% 0.0089% 基因突变筛查项目 AML基因突变筛查(11种) CEBPA;DNMT3A;FLT3-ITD/TKD;IDH1;IDH2;KIT;KRAS;NPM1;NRAS;TE

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