第一章原核微生物分类和代表讲述.ppt

第一章 原核生物 The Prokaryotes （分类方法及主要代表类群 ） 原核微生物的分类 生物的分类系统 70年代后期，沃斯(Wose 1978) 根据核糖体结构、16SrRNA的碱基序列将生物划分为3个域(domain)或原界 古细菌原界：由甲烷菌、嗜盐菌、嗜热菌等 真细菌原界：除古细菌外其它原核生物 真核生物原界：原生生物、真菌、动物、植物 原核生物的分类系统 当前比较有权威的分类系统有三个： 前苏联克拉西尼柯夫系统 法国的普雷沃系统 美国的伯杰氏系统 伯杰氏系统简介 《伯杰氏细菌鉴定手册(第九版)》将原核微生物分为35群，归纳为四大类(或四个门)： 第一类：具细胞壁的革兰氏阴性真细菌 第二类：具细胞壁的革兰氏阳性真细菌 第三类：无细胞壁的真细菌 第四类：古细菌 《伯杰氏系统细菌学手册》第二版将原核生物分为古细菌和真细菌2个界，下设25门，39纲，89目，207科，包括852属，5000余种，分为五卷本出版。 原核生物的分类和鉴定 细菌分类学包括三个方面： 分类（classification）：根据各种细菌的相似性进化关系将其分为类群，排放在适当的单元中 鉴定（identification）：是分类的操作过程，经过一系列测定来确定所研究的菌株属于哪个类群 命名(nomenclature)：根据命名的国际法规对所鉴定的菌株给以科学名称 原核生物的分类单位 原核生物的分类等级 原核生物界(Kingdom)、门(Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)。 种的概念 种是分类的基本单位，是表型特征和包括DNA和16SrRNA在内的基因序列特征高度相似的菌株群，且和其它类群又有明显的差别。 这些词尾是: 目的词尾ales 亚目的词尾ineae 科的词尾aceae 亚科的词尾oideae 族的词尾eae 亚族的词尾inae 属、种没有共同的词尾 菌种命名原则 按《国际细菌命名法则》命名，该方法采用的是林奈在1753年提出的双命名法 学名：属名+种名加词（斜体表示） 属名：拉丁文或希腊文，名词，单数，第一个字母大写，描述微生物的一般的和主要的特征 种名加词：拉丁文或希腊文，形容词，字母小写, 描述该菌具体的、次要的特征, 并在学名之后写出命名人的姓氏 种以下分类 亚种（subspecies, subsp.）：指某一明显而稳定的特征与模式种不同的种，例： 蜡状芽胞杆菌的蕈状亚种： Bacillus cereus subsp. Mycoides 型（form或type）：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可细分不同的型，如：依据抗原特征的不同可分为不同的血清型 变种（Variety, Var.）：现一般不使用 枯草芽胞杆菌墨色变种：Bacillus subtilis var. niger 当某一菌株被鉴定为一个新种或新的亚种时，该菌株就应指定为该种或该亚种的模式菌株；如果有几个菌株同时被鉴定为一个新种，同指定其中一个具代表性的菌株用为模式菌株 分类中的几个概念 菌株（strain）：由一个独立的单细胞繁殖形成的微生物纯种群体，将使用较广泛某菌的菌株名称加在菌种学名之后，可任意取名，例： 华癸中生根瘤菌7653R菌株： Mesorhizobium huakuii 7653R 培养物：是指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。如果某一培养物是由单一微生物细胞繁殖产生的，就称之为该微生物的纯培养物（pure culture） 群（population）：在自然界中有些微生物的种类其特征介于两个种之间，彼此不易严格区分，于是我们就把这两个种和介于它们中间的一些微生物统称为一个“群”。例大肠杆菌群就是大肠杆菌和产气杆菌及其中间类型微生物的统称 原核生物分类鉴定的依据和方法 生物分类和鉴定的依据 高等动物：外部形态、内部解剖结构 种子植物：生殖器官特征；花、果实 微生物：个体形态、群体形态、生理生化、免疫、遗传等 微生物形体小、类型多、易变异，使其分类、鉴定远较其它生物复杂 (1) 形态 (2) 大小: 菌体 宽×长 或者直径大小 (3) 细胞排列方式 (4) G