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2013-014分子生物学复习资料.doc

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2013-014分子生物学复习资料

2013-2014分子生物学复习资料 一、中心法则 DNA RNA 蛋白质 二、DNA复制 (一) DNA复制的特点 1、半保留复制 DNA复制时分别以两条亲代链作为模板链通过酶催化各形成一条子代链,亲代链分开处即子代链合成处成为复制叉。 2、半不连续复制 DNA亲代链5’到3’方向的复制时,是以小片段的形式从5’到3’不连续的复制形成冈崎片段,再经DNA连接酶连接形成一条链。 3、RNA的引导 RNA的引导保证DNA复制的高忠实性。 (二) DNA复制所需要的酶 1、原核中: (1)DNA解旋酶:利用ATP水解的能量解开双链DNA (2)DNA旋转酶(Ⅱ型拓扑异构酶):引入负超螺旋从而释放正超螺旋。 (3)DNA聚合酶Ⅲ:延伸前导链和后随链中的引物。 (4)DNA聚合酶Ⅰ:切除引物。 (5)DNA连接酶:连接冈崎片段形成DNA子代链。 2、真核中: (1)DNA聚合酶α:前导链和后随链的每个片段都是利用其引发酶活性从RNA引物开始。 (2)DNA聚合酶δ:在前导链上替代前一种酶继续延伸。 (3)DNA聚合酶ε:在后随链上完成DNA的复制。 (三) DNA聚合酶 1、真核中:真核细胞有5种DNA聚合酶,分别为DNA聚合酶α(定位于胞核,参与复制引发具5-3外切酶活性),β(定位于核内,参与修复,具5-3外切酶活性),γ(定位于线粒体,参与线粒体复制具5-3和3-5外切活性),δ(定位核,参与复制,具有3-5和5-3外切活性),ε(定位于核,参与损伤修复,具有3-5和5-3外切活性)。 2、原核中:原核细胞有3种DNA聚合酶,都与DNA链的延长有关。DNA聚合酶I是单链多肽,可催化单链或双链DNA 的延长;DNA聚合酶II则与低分子脱氧核苷酸链的延长有关;DNA聚合酶III在细胞中存在的数目不多,是促进DNA链延长的主要酶。 功能 polⅠ polⅡ polⅢ 聚合作用5→3? + + + 外切酶活性3→5? + + + 内切酶活性5→3? + - + 焦磷酸解和焦磷酸交换作用 + - + 完整的DNA双链 - - - 带引物的长单链DNA + - - 带缺口的双链DNA + - - 双链而有间障的DNA + + + 分子量(kd) 109 120 140 (四)DNA的损伤与修复 1、诱变 (1)突变 1) 点突变:一个单一碱基的改变 转换:嘌呤与嘌呤之间或是嘧啶与嘧啶之间 颠换:嘌呤与嘧啶之间或是嘧啶与嘌呤之间 2) 沉默突变:突变发生在DNA的非编码区、非调节区或密码子的第三个碱基位置,不影响掺进蛋白质中的氨基酸 3) 错义突变:突变改变了基因产物的一个氨基酸 4) 移码突变:插入或缺失涉及一个或多个碱基的增加或丢失 (2)物理诱变:高能离子化辐射,如X射线、γ射线、紫外线(嘧啶二聚体是常见的一种产物) (3)化学诱变:碱基类似物(直接诱变)、亚硝酸、烷化剂等 2、损伤 (1)氧化性损伤 (2)烷基化(如MMS、ENU) (3)聚化加合物 3、修复 (1)光复活:在可见光下,DNA光解酶可将环丁烷嘧啶二聚体再分解为单体 (2)烷基转移酶 (3)切除修复:核苷酸切除修复和碱基切除修复 (4)错配修复 (5)遗传性修复 (五)DNA的克隆 1、DNA的制备 (1)质粒DNA的制备 碱裂解法:从染色体DNA及大部分其他细胞成分中纯化 酚抽提法:采用酚或酚-氯仿混合物进行抽提 乙醇沉淀: 氯化铯梯度法: (2)噬菌体DNA的制备 2、载体 (1)质粒载体 1) 插入失活原理:pBR322及其衍生物包含两个抗生素抗性基因,ampr和tetr,当目的基因插入其中一个时,会导致该基因失活。 2) 蓝白斑筛选:在质粒中含有LacZ基因(编码β-半乳糖苷酶,受Lac启动子的调控)的α-肽的序列,当无外源DNA片段插入时,质粒表达α-肽,它与宿主菌的Lac ZM15基因的产物互补,产生有活性的β-半乳糖苷酶,在含有指示剂X-gal和诱导剂IPTG存在的情况下,菌落呈蓝色(质粒自身环化);外源基因插入后,肽基因阅读框架被破坏,细菌内无半乳糖苷酶活性存在,菌落呈白色(阳性克隆)。 (2)噬菌体载体 噬菌体颗粒将其线性DNA注入细胞,进而DNA连成环状,其后该DNA被复制组装成噬菌体颗粒,经裂解细胞释放到胞外,造成细胞死亡,或通过特异位点将其DNA整合到宿主基因组,而获得长期插入。 (3)其他载体 黏粒载体:利用λ噬菌体cos位点 YAC:酵母人工染色体 BAC:细菌人工染色体 (六)基因文库 1、基因组文库(DNA来自基因组DNA) 文库的大小,p代表给定概率,f是插入片段大小占总基因大小的比例。 2、cDNA文库(DNA来自群体mRNA的拷贝) cDNA第二条链的合成: a) 自身引物合成法:cDNA/mRNA杂合体用碱

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