系统进化关系.PDFVIP

第 43 卷 第 1 期 海 洋 与 湖 沼 Vol.43, No.1 2012 年 1 月 OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA Jan., 2012 脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)3 个野生群体 mtDNA 16S rRNA 序列差异及长臂虾科 系统进化关系* 马 朋1, 2 刘 萍1① 李 健1 李吉涛1 高保全1 (1. 中国水产科学研究院黄海水产研究所 青岛 266071; 2. 大连海洋大学 大连 116023) 提要 采用 PCR 扩增和序列测定等技术, 对脊尾白虾 3 个野生群体共计 58 个个体的线粒体 16S rRNA 基因片段进行初步研究。结果表明, 在获得的长度为 509bp 核苷酸序列中, 共检测到 7 个变异 位点、8 种单倍型, 除象山湾群体外其它两个群体遗传多样性水平都较低。AMOVA 分析表明, 象山 湾与莱州湾群体有显著的遗传差异, 其余群体间的遗传差异不显著。另外, 将本研究所得序列与 GenBank 中长臂虾科 11 个种的 16S rRNA 基因片段序列进行比较后, 发现其聚类关系与传统分类略 有不同, 并依据 16S rRNA 序列变异百分比推测了长臂虾科 12 个种的大致分化时间。 关键词 脊尾白虾, 16S rRNA 基因, 遗传多样性, 系统进化 中图分类号 Q347 脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)又名白虾, 了初步分析, 并探讨了长臂虾科系统进化关系。以期 隶属节肢动物门(Arthropoda)、甲壳纲(Curstacea)、十 为脊尾白虾种质资源的管理、保护和利用提供理论上 足目(Decapoda) 、游泳亚目(Natantia) 、长臂虾科 的依据, 同时为长臂虾科系统发育重建工作提供一 (Palaemonidae)、白虾属(Exopalaemon)。广布于整个 定参考。 中国大陆沿岸和朝鲜半岛西岸的浅海低盐水域, 渤 1 材料与方法 海和黄海数量最大, 为最重要的小型经济虾类(许文 军等, 2010)。 1.1 实验材料 目前国内学者对脊尾白虾的生物学、养殖生态学 实验用脊尾白虾(Exopalaemon carinicauda)分别 等(刘重斌等, 2009)方面进行了不同程度的研究。但 采自渤海的莱州湾(LZ)、黄海的海州湾(HZ)和东海的 分子遗传学的研究报道较少, 运用分子生物学手段 象山湾(XS), 带回实验室后?80℃保存备用。 可以有效地进行物种间的分类学研究(黎中宝等, 1.2 实验方法 2008; 杨建敏等, 2008)。线粒体 DNA (mitochondrial 1.2.1 基因组 DNA 的提取与检测 每个群体中随 DNA, mtDNA)序列分析是 DNA 多态分析技术中最有 机抽取 19—20 个个体, 每个个体取约 100mg 腹部肌 效的方