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第十三届全国医药卫生青年科技论坛稿件基本要求
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第十三届全国医药卫生
青年科技论坛稿件基本要求
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附件2
姓 名 宋咏梅 性别 女 年龄 45 单位科研处盖章 工作单位 中国医学科学院肿瘤医院 职称 研究员 学位 医学硕士 手 机 E-mail 民族 汉 主题领域(勾选) √□基础 □临床 □药物 □公卫 食管鳞癌的基因组变异谱研究
宋咏梅,詹启敏
(中国医学科学院北京协和医学院 肿瘤医院
分子肿瘤学国家重点实验室,100021,北京)
目的:通过基因组测序、aCGH和功能生物学研究揭示食管鳞癌的基因组变异特征。
方法:17例食管鳞癌进行全基因组测序、71例进行外显子组测序、123例进行aCGH检测,通过分析SNV、CNV、indel、SV数据,综合研究了食管鳞状细胞癌基因组数据概况、突变频谱、重要突变基因、组蛋白修饰相关基因突变、拷贝数变异、结构变异、重要通路变异以及药物靶基因变异,并且通过构建的野生型与突变型质粒,研究了突变基因、扩增区域microRNA的生物学功能。
结果:研究发现了8个与食管鳞癌发生相关的重要的基因突变,其中FAM135B是首次发现的肿瘤相关基因;获得了食管鳞癌拷贝数变异的重要数据,发现位于染色体11q13.3-13.4扩增区域的MIR548K参与食管鳞癌的恶性表型的形成,这些基因的变异是食管癌发生发展的重要因素,与食管癌的预后密切相关;发现重要组蛋白调节基因MLL2、ASH1L、MLL3、SETD1B 和CREBBP/EP300在食管鳞癌中呈现频繁非沉默突变;对潜在治疗靶点进行分析,发现PI3K是食管鳞癌突变频率最高的潜在药靶,并发现PSMD2、 RARRES1、 SRC、GSK3β和SGK3等潜在新药靶。整合了所有基因突变和基因拷贝变异数据,确定了与食管鳞癌发生发展相关的重要信号通路,包括Wnt、cell cycle、Notch、RTK-Ras和AKT通路。
结论:全面揭示了食管鳞癌的基因组变异特征,这些发现能够确定新的突变和扩增基因, 研发临床分子标志物和潜在药靶,FAM135B、microRNA548K未来可能作为食管鳞状细胞癌诊断的标记物或者治疗的靶点。
关键词:食管鳞癌 基因组 变异谱 第十三届全国医药卫生青年科技论坛稿件格式
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