历史与背景-医学信息研究所.ppt

NCBI网站介绍 National Center forBiotechnology InformationNCBI网站简介 1988年，美国的参议员 Claude Pepper 发起 1988年11月4日通过立法建立国立生物技术信息中心 NCBI的任务: 建立基于计算机的信息处理的关于分子生物学，生物化学，和遗传学知识的存储和分析的自动系统。并进行先进方法的研究。 促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。 促进全世界范围内的生物技术信息收集的合作 NCBI生物信息整合系统Entrez 用途 PubMed书目文献数据 获取GenBank, EMBL等数据库的核酸序列； 获取Swiss-port,PIR,PRF,PDB等蛋白质序列；从核酸序列翻译到蛋白质的序列； 蛋白质三维结构数据及大分子模式（MMDB）等其他生物信息数据库检索 获取基因组图谱信息 因特网上检索免费MEDLINE 一.历史与背景 INDEX MEDCUS MEDLARS ONLINE MEDLINE CD MEDLINE WEB PubMed 数据类型：期刊论文、综述、以及与其他数据资源链接。 特点： 1.免费提供题录和文摘2.可与提供原文的网址链接 (部分免费获取） 3. 提供检索词自动转换匹配4. 操作简便、快捷 数据收录 MEDLINE 4300余种生物医学期刊，内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科。这些期刊来源于美国和世界上70多个国家和地区。 文献量达1千1百万条记录，并回溯到1966年。 [indexed for MEDLIEN] In process citation 提供MEDLINE尚未经规范处理的数据。 获MeSH词后，再加入MEDLINE。 记录中[in process]的标记。 Publisher Supplied Citations 出版商直接向PubMed提供电子记录 包括MEDLINE未收录的部分记录 PubMed 与MEDLINE的区别 收录范围广：MEDLINE收录的部分生命科学相关文章的非医学专业期刊（物理、天文、化学等） 收录记录新：在MEDLINE数据标引前的必威体育精装版题录 文献类型全：提供电子原文链接（部分免费） 自动转换检索词（automatic term mapping） 自动对照规范词表,期刊名表，短语，著者名索引, 依次寻找转换 短语寻找转换 单词转换 单词在上述四个字段寻找转换 在所有字段中转换 如：输入stem[ti] AND neuroscience Details显示： (stem[ti] AND (neurosciences[MeSH Terms] OR neuroscience[Text Word])) 截词检索：treat* 强迫短语检索：“brca 1”（不再自动转换匹配和扩展检索） 自动扩展检索 系统自动对主题词、副主题词进行扩展检索，如： 输入“hypertension therapy,系统自动将高血压的药物治疗、饮食疗法， 三.PubMed的辅助检索功能 Limits（检索限制选择） 字段限制：著者、刊名、篇名、滤过（filter原文收藏处）等 数据输入时间：默认检索可回溯到1966年，限制选择30天-10年 7种文献类型限制： 7种语种： 12种子文档：(01年新增2种Space Life Sciences and Bioethics ） Previw/index（检索策略预览） 浏览检索式 改变检索式 （可用检索式编号#1 OR #2） 浏览索引（index） Index（索引字顺表） 选择限制字段 输入检索词（词根） 在字顺表中选择检索词 选用逻辑算符建立检索式 点击GO  History 检索式回顾 编辑检索式 如#3 AND child Details 显示检索词转换匹配运算详细过程 用途： 转换、确定规范词 如：liver cancer liver neoplasms 修改检索策略 修改检索策略 1.检索框中随时修改 2.“Limit” 、 “Preview/index”、 “History” “Details”功能键实现。 四.检索结果输出 显示检索结果 保存检索结果 保存检索策略 打印检索结果 显示字段选择（Display) Abstract report:来源期刊、标题、著者、著者地址、记录性质、文献类型、勘误、评论、PMID或UI、摘要。 Citation Report: 显示除上述内容外，加MeSH叙词、化学物质名称、资助项目号等字段。 MEDLINE Report: (最完整，有标识符） 显示记录选择 单一记录：著者姓名