生物信息学及其在病毒研究中的应用生物信息学及其在病毒研究中的应用.pdf

. . 第3 2 卷 第 3 期 上海师范大学学 报(自然科学版 ) V o l 3 2 , N o 3 以 山 以 磁 ve 招 认 at u r e . 2 0 0 3 年 9 月 J~ of sh ‘gh N ~ U y(N al sci ~ ) S p 2 0 0 3 生 物 信 息 学及 其在病 毒研 究 中的应 用 肖 明 ‘ , (上海师范大学 生命 与环境科 学学院 上海 2 加2 3 4) . 摘 要 : 介绍 生物 信 息学的原理 与方 法及 其在病毒研 究 中的应 用 保 守序列 承担 着极其 重要 的功 能 , 通过 多重序 列对 齐搜 寻保 守序 列 , 是 生 物 信 息 学方 法 的基 础 ; 敏 感 位 点是 一 种反 映 蛋 白质 或核酸 功 能的特定模式 , 因此 , 通 过数 量 关 系的优 化 推 导敏感位 点 , 可 用 于分 离病毒 蛋 白质 与核酸 相互 作 用 位 点 ; 核 普酸和氛基 酸序 列只 有形成 了三级 或四 级 结 构 才能表现 功 能 , 、 通过 同 源建模预 测 蛋 白质 的 高级 结 构 , 有助 于疫 苗的研 制 抗病毒药物 的筛选 以 及 药物的 分 子 . . 设计 预 测 R N A 的三级 结 构 大 多从 R N A 折 叠入手 病毒蛋 白质 三级 结 构 预 刚 比 较成 功 的 是 . 日本 脑炎病毒 包膜糖 蛋 白的三级 结 构 关键 词 : 生物信 息 学; 保 守序列 ; 同 源建模 中圈分类 号 : 07 3 文献 标识码 : A 文章 编号 :l o0 一37( 20 3 )03 ( 旧9 6 切 , , . 至 2 0 0 3 年 3 月 止 收录在 Ge n Ba nk 已 测基 因组 全序列的病毒种类达 107 5 种 而且 正 以每年20 1 % . . 的速度递 增 川 依靠传统的研 究思想 和实验 手段 注释如此 庞大 的生 物信息资 源是 不 可能的 生 物信息 , , . 学 的出现 为解 决这个难题带来 了希望 而 且在短 短 的几年里 做出了惊