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生物信息学方法在判断DNA结合蛋白质和预测结合位点中的应用生物信息学方法在判断DNA结合蛋白质和预测结合位点中的应用
# 综述与专论 # 486 2009, Vol. 33, No. 11
2009年第 33卷 第 11期 第 486页 Progress in Pharmaceutical Sciences
综述与专论
do:i 10. 3969/ .j issn. 1001- 5094. 2009. 11. 001
生物信息学方法在判断 DNA 结合蛋白质
和预测结合位点中的应用
刘子朋 1, 章宏九 2, 李雅晴 2, 朱云蛟 2, 胡 健 1, 方慧生 1*
( 1. 中国药科大学生命科学与技术学院, 江苏 南京 210009; 2. 中国药科大学药学院, 江苏 南京
210009)
[ 摘要 ] 综述生物信息学方法在判断 DNA 结合蛋白 质和预测 结合位 点中的 应用研 究进展。蛋 白质与 DNA 间的
相互作用是基因表达调控的分子 生物学基础, 因此 DNA 结合蛋白的 判断以及 DNA 与蛋白质 间作用位 ??的预测一
直以来都是分子生物学 和生物信息学的前沿领域。采用生 物信息 学方法 进行这类 判断和 预测, 具有 省时、省力的
特点, 近年来吸引了众多科学家的关注。
[ 关键词 ] 生物信息学; 蛋白质-DNA 相互作用; DNA 结合蛋白; 结合位点预测
[ 中图分类号 ] Q 513 [文献标识码 ] A [ 文章编号 ] 1001- 5094( 2009) 11- 0486- 05
The App lication of BioinformaticalMethod in D istinguishing the DNA-binding
Prote in and Predic ting the Binding Site in Protein-DNA Interface
LIU Z-i peng1, ZHANG H ong-jiu2, LI Ya-q ing2, ZHU Yun- jiao2,
1 1
HU Jian , FANG H u-i sheng
(1. School of Life Science and Technology, China Pharmaceutical University, Nanjing 210009, China;
2. School of Pharm acy, China Pharm aceutical University, Nanjing 210009, China )
[Abstract] The research progress in application o f bio inform aticalm ethod in distingu ishing the DNA-
b inding prote in from the other pro te ins and pred icting the b ind ing sites betw een DNA and protein w as
review ed. Genetic regulation is com pleted by protein-DNA interaction and therefore how to d istingu ish
DNA-binding protein from the other proteins and further predict the b ind ing sites betw een protein and
DNA is alw ays the frontier fie ld in the m o lecu lar b i
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