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柞蠶功能基因研究进展--沈阳农业大学柞蚕研究所刘彦群研
柞蚕功能基因研究进展——沈阳农业大学柞蚕研究所刘彦群研究组
汇报人:
刘彦群、李玉萍
2011.03;一、研究组简介
二、研究进展
三、当前重点研究工作
;背景:
在家蚕基因组与功能基因组研究取得巨大进展和成功的背景下,我们于2008年组建了柞蚕基因组与功能基因组研究组。 ;人员:
固定成员已由最初的2人增长为6人(刘彦群、李玉萍、夏润玺、王欢、李群、秦利)。
现有研究生6人,今年准备招生4人。包括特种经济动物饲养、动物学两个专业。 ;研究领域:
(1)以构建的柞蚕全长cDNA文库和完成的柞蚕转录组信息资源为平台,克隆和鉴定柞蚕特异基因和重要功能基因;
(2)利用基因组学技术和分子系统学方法,开展柞蚕遗传与进化研究。
;目前承担的国家自然科学基金课题:
(1)面上项目(柞蚕蛹滞育解除期高丰度表达的KK-42结合蛋白基因的功能分析; 2011.01 ~ 2011.12;刘彦群)。
(2)青年科学基金(柞蚕mtDNA控制区遗传多样性与系统进化;2009.01 ~ 2011.12;刘彦群)。
(3)面上项目(柞蚕神经肽PBAN的受体鉴定及其作用的信号转导分析;2011.01 ~ 2013.12 ;魏兆军、李玉萍)。;发表论文:
2008年至今, 在《International Journal of Biological Sciences》、《Annals of the Entomological Society of America》、《Journal of Insect Science》、《Molecular Biology Reports》、《Acta Biochimica et Biophysica Sinica》、《蚕业科学》等发表24篇相关论文,包括13篇SCI论文(2008年1篇;2009年2篇;2010年9篇;2011年已发1篇,已投稿2篇)。;1、柞蚕EST测定与转录组测序
2、柞蚕功能基因克隆
;EST测定:
(1)构建了一个柞蚕全长cDNA文库,为基因的克隆奠定了基础;
(2)获得了1500条柞蚕EST,拼接后得到779个一致性序列,被注释的一致性序列达533个,未被注释的一致性序列达246个;
(3)识别了200个新的EST;
(4)获得了313条柞蚕基因全长cDNA序列。 ;转录组测序:
(1)合作者合肥工业大学魏兆军博士研究组已经利用Solexa技术完成了滞育解除期柞蚕蛹的转录组分析。总共获得84322 个contig,注释为38438 个unigene。
(2)我们正在利用同样的技术进行滞育中期蛹的转录组分析。仍将进行注定滞育蛹和注定不滞育蛹的转录组分析。
(3)旨在分离与柞蚕滞育相关的基因。;(1)鉴定了柞蚕KK-42结合蛋白基因,查明其与蛹滞育密切相关。
(2)鉴定了烯醇化酶I、II基因。烯醇化酶I基因在温度刺激时是可调的。烯醇化酶II基因与生殖有关。
(3)鉴定了柞蚕溶血磷酯酶基因、长寿基因、肌球蛋白轻链2基因、异常翅节蛋白基因、腺苷酸转移酶基因、延伸引子-1α基因、肌动蛋白基因。; 最近,又鉴定了柞蚕血小板活化因子乙酰水解酶基因、亚精胺合成酶基因、磷酸丝氨酸转氨酶基因、硒磷酸化物合成酶基因、赖氨酰-tRNA合成酶基因、牻牛儿基牻牛儿醇转移酶、NIMA相关激酶基因等,完成了表达模式分析。还分离了4个小分子量热激蛋白基因、1个微卵黄原蛋白基因。相关论文正在整理中。;1、柞蚕蛹滞育相关的KK-42结合蛋白基因的功能分析
2、利用转录组技术分离柞蚕蛹滞育相关基因 ;1、KK-42结合蛋白基因的功能分析:
(1)咪唑类化合物(KK-42)是一种昆虫生长调节因子,能加快昆虫(如柞蚕、天蚕、家蚕等)甚至节肢动物(如对虾)幼虫的早熟变态;
(2)并且能解除天蚕的卵滞育和棉铃虫的蛹滞育。我们的试验表明,也能解除柞蚕的蛹滞育(需要进一步重复验证)
;1、KK-42结合蛋白基因的功能分析:
(3)KK-42结合蛋白与天蚕的卵滞育解除有直接关系(Shimizu et al., 2002; Yang et al., 2008) 。
(4)表达谱分析表明,柞蚕KK-42结合蛋白基因在4个发育阶段和所有组织器官中均表达,并且与柞蚕的蛹滞育密切相关(滞育期不表达),而且在滞育解除后期高丰度表达。
(5)序列比对和进化分析表明,KK-42结合蛋白具有两个脂肪酶活性功能域,是脂肪酶的新成员。;1、KK-42结合蛋白基因的功能分析:
(6)将系统研究KK-42处理对柞蚕生长发育的影响;
(7)将利用免疫细胞化学技术进行该蛋白的亚细胞定位;
(8
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