2007～2008年国际反刍动物营养研究进展 Ⅰ.瘤胃微生物多样性和功能2007～2008年国际反刍动物营养研究进展 Ⅰ.瘤胃微生物多样性和功能.pdf

中 国畜 牧 兽 医? ????年第 ??卷 第 ?期? 特约 综 述? · ? ·? ????? ????年 国际反刍 动物 营 养研 究进展? ?．瘤 胃微 生 物 多样 性 和功 能? 刘开 朗 ，王 加启 ，卜登攀 ，李 旦 ，于萍 。赵 圣 国 ，奚 晓 琦? ?中 国农 业 科 学 院北 京 畜 牧 兽 医研 究 所 动 物 营养 学 国家 重 点 实验 室 ，北 京? ???????? 摘 要 ：随着 试 验 生 物学 和 生 物 信 息学 的快 速 发 展 ，对 瘤 胃微 生 物 的 多样 性 和功 能 开展 了系 统 的 研 究 。笔 者 综 述 了 ?????? ????年 在 ????、?????????大会 和 ??????等 数 据库 中与 瘤 胃微 生 物 分 子 多 态 性 和元 基 因 组 学 相 关 的 ??篇 文 献 。 瘤 胃? 微 生物 群 落 在 “属 ”分 类 水 平 上多 样 性 水平 较 低 ，在 亚 种 或 菌 株 水 平 上 表 现 出 极 大 的 多 样 性 ，多 样 性 指 数 估 计 表 明 ，瘤 胃 内 细? 菌 种类 约 为 ???多 种 ，而 菌株 类 型 ?独 特 序 列 型 ?约 为 ?????种 。瘤 胃微 生 物 群落 结 构 受 到 宿 主 遗传 背 景 、生 长 发 育 阶段 、日? 粮 、环 境 条件 等 多 种 因 素 的影 响 。 瘤 胃微 生 物 组 中蕴 藏 了大 量具 有 应 用 潜 力 的 遗 传 资 源 ，这 些 结 果 为 准确 了解 瘤 胃微 生 物群? 落 结构 、功 能及 其 调 控方 式 提 供 了 重 要 的基 础 。? 关 键 词 ：瘤 胃微 生物 群 落 ；多 样 性 ；分 子 生 态 学 ；元 基 因组 学? 中 图分 类 号 ：???? 文献 标 识 码 ：?? 文章 编号 ：?????????????????—????—??? 瘤 胃作为反 刍动 物 的消 化器 官 ，是迄 今 为止 已? 瘤 胃微生物是 反刍动 物必不可 少而独特 的组成? 知 的降解 转化植物纤 维素类 物质效率最 高 的天然 体? 部 分 。前 人的研究 通常将 动物消化 道微 生物群落 与? 系 ，它依赖 瘤 胃微 生物群体 的协 同作用 ，将天然纤 维? 宿主 的关 系归纳 为共栖 ?一 个种类受 益 ，而另一个 种? 类 物质快 速 降解 转 化 成 一 系列 动 物 营 养 和 能 源 物? 类 不受影 响?或互 惠共生 ?两个 种类都受 益?。但是 ，? 质 。反 刍动物 的瘤 胃为微生 物提供 了 良好 的栖息 环? “共栖”不 能正确地 描述动物 消化道微 生物群落个 体? 境 ?温度为 ??．?～??．????，?? 为 ?．?～?．?，氧化 还? 对 于 其 他 个 体 或 宿 主 的 有 益 作 用 ????????等 ，? 原 电位为 ? ???? ???????。成 年 牛 瘤 胃中栖 息? ?????。现 在 ，许多研 究者将 动物消化道微 生物群 落? 的微生物 包 括 细 菌 ?超 过 ???种 ，活 菌 数 高 达 ??“? 看 作是宿 主的一个 器 官 ，这 主要 是 因为 微 生物 群落? 个 ／???、原 虫 ?超 过 ??个 属 ，其 数 量 为 ???～ ??? 由多种细胞 系组 成 ，细胞 间 或细 胞 与宿 主之 间 具有? 个 ／???、