基于线粒体COI基因的雷州半岛马尾藻属常见种DNA条形码鉴定及系统进化分析.pdfVIP

第 36 卷 第 4 期 广东海洋大学学报 Vol.36 No.4 2016 年 8 月 Journal of Guangdong Ocean University Aug. 2016 doi: 10.3969/j.issn.1673-9159.2016.04.004 收稿日期：2016-06-07 基金项目：2016 年度广东大学生科技创新培育专项资金立项项目（pdjh2016b0236）；中央分成海域使用金支出项目（2011-2-2-09-3）； 广东省海洋渔业科技推广专项（A201308E02）；广东省科技计划项目（2012B020307006） 第一作者：贺亮（1990－），男，硕士研究生，从事海洋生境修复与生物资源保护研究。E-mail: gdhydxhl1990@ 通信作者：刘丽（1974－），女，教授，主要从事海洋生物保护及遗传多样性研究。E-mail: zjouliuli@163.com 基于线粒体 COI基因的雷州半岛马尾藻属常见种 DNA条形码鉴定及系统进化分析 贺 亮，廖 健，全秋梅，梁 忠，谢恩义，刘 丽，刘楚吾 （广东海洋大学水产学院 南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室，广东 湛江 524025） 摘 要：采用 DNA 条形码技术辅以传统形态分类方法，对雷州半岛马尾藻属（Sargassum）6 常见种进行物种鉴 定和系统进化分析。测得 6 种马尾藻线粒体 COI 基因序列，该序列与 GenBank 和 BOLD 数据库中马尾藻序列同 源性均大于或等于 99%，该结果与形态分类学鉴定结果一致。COI 基因序列特征分析表明，6 种马尾藻保守位点 421 个，变异位点 58 个，简约信息位点 21 个，单一突变位点 37 个，变异率 7.7%，T、C、A、G 平均含量分别 为 39.1%、18.9%、19.1%、22.9%，A+T 含量（58.2%）高于 C+G 含量（41.8%），UUU 所编码的苯丙氨酸（F） 使用频率最高，达 12.5%，最大似然法估算的转换颠换比值为 2.42，种间遗传距离多在 0.030±0.013 ~ 0.100±0.016 之间。聚类分析结果与形态学鉴定、同源性分析结果一致。 关键词：马尾藻属；mtDNA-COI 基因；物种鉴定；分子系统进化；DNA 条形码 中图分类号：Q78；Q949 文献标志码：A 文章编号：1673-9159（2016）04-0017-06 DNA Barcoding and Phylogenetic Analysis of Common Species of Sargassum from Leizhou Peninsula Based on mtDNA-COI Gene Sequences HE Liang, LIAO Jian, QUAN Qiu-mei, LIANG Zhong, XIE En-yi, LIU Li, LIU Chu-wu （Key Laboratory of Aquaculture in South China Sea for Aquatic Economic Animal of Guangdong Higher Education Institutes, Fisheries College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524025,China） Abstract: Species identification and phylogenetic relationship in 6 common species of Sargassum collected from Leizhou Peninsula were analyzed by appling DNA barcoding technology assisted traditional morphological classification method. Mt-DNA COI gene sequences of 6 species of Sargassum and existing data in GenBank and BOLD database for homology analysis showed that the similari