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生化期末复习讲解
变旋现象
许多单糖,新配置的溶液会发生旋光度的改变,这种现象称为变旋。环状单糖或糖苷的比旋光度由于其α-和β-端基差向异构体达到平衡而发生变化,最终达到一个稳定的平衡值的现象。变旋现象往往能被某些酸或碱催化。由于单糖溶于水后,即产生环式与链式异构体间的互变,所以新配成的单糖溶液在放置的过程中其旋光度会逐渐改变,但经过一定时间,几种异构体达成平衡后,旋光度就不再变化,这种现象叫变旋现象。?例如在不同条件下获得的D(+)-葡萄糖,其比旋值不同。从低于30℃的乙醇中结晶的,熔点146℃,[α]D20=+112.2度,称为α-型;从98℃吡啶中结晶的,熔点148-155℃,[α]D20=+18.7度,称为β—型。这两种晶体分别溶于水中,放置一定时间后,其比旋达到同一恒定值,+52.6度。比旋是由于分子立体结构发生某种变化的结果。
单糖的氧化
氧化成醛糖酸:醛糖含游离醛基,具??很好的还原性。碱性溶液中重金属离子(Cu2+,Ag+,Hg2+或Bi3+等)如Fehling试剂(酒石酸钾钠,氢氧化钠和CuSO4)或Benedict试剂(柠檬酸,碳酸钠和CuSO4)中的Cu2+是一种弱氧化剂,能使醛糖(还原剂)的醛基氧化成羧基,产物称醛糖酸,金属离子自身被还原。能使氧化剂还原的糖称还原糖。所有的醛糖都是还原糖;许多酮糖也是还原糖,例如果糖,因为它在碱性溶液中能异构化为醛糖。
(2)氧化成醛糖二酸如果使用较强的氧化剂如热的稀硝酸,醛糖的醛基和伯醇基均被氧化成羧基,形成的二羧酸称醛糖二酸或糖二酸,例如β-D-葡萄糖被氧化成D-葡糖二D-和L-葡萄糖经硝酸氧化,得到相应的D-和L-葡糖二酸,它们也可以分别从L-和D-古洛糖氧化获得;D-和L-甘露糖也分别给出有光学活性的甘露糖二酸;但D-和L-半乳糖给出同一的半乳糖二酸,也称粘酸,它是一个无光学活性的内消旋化合物,分子内存在一个对称面。
(3)氧化成糖醛酸
某些醛糖在特定的脱氢酶作用下可以只氧化它的伯醇基而保留醛基生成醛酸,例如葡糖醛酸。
非极性R基氨基酸:
这一组共有8种氨基酸。4中带有脂肪烃侧链的氨基酸,即丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸;两种含芳香环氨基酸:苯丙氨酸和色氨酸;一种含硫氨基酸和一种亚氨基酸,脯氨酸。这组氨基酸在水中的溶解度比极性R基氨基酸小。这组氨基酸中以丙氨酸的R基疏水性为最小,它介于非极性R基氨基酸和不带电荷的极性R基氨基酸之间。
带正电荷的R基氨基酸:
这是一组碱性氨基酸,在pH7时携带正净电荷。属于碱性氨基酸的有赖氨酸、精氨酸和组氨酸。赖氨酸除α﹣氨基外,在侧链的ε位置上还有一个—NH3;精氨酸含有一个带正电荷的胍基;组氨酸有一个弱碱性的咪唑基。在pH6.0时,组氨酸分子50%以上质子化,但在pH7.0时,质子化的分子不到10%。组氨酸是唯一一个R基的pKα值在7附近的氨基酸。
二级结构:
二级结构在生物化学及结构生物学中,是指一个生物大分子,如蛋白质及核酸(DNA或RNA),局部区段的三维通式。然而它并不描述任何特定的原子位置(在三级结构中描述)。
二级结构是由生物大分子在原子分辨率结构中所观察到的氢键来定义的。蛋白质的二级结构通常是以主链中氨基之间的氢键模式来定义〈与主链-侧链间以及侧链-侧链间的氢键无关〉,亦即DSSP的定义。[1]而核酸的二级结构是以碱基之间的氢键来定义。
一般认为,驱动蛋白质折叠的只要动力是熵效应。折叠的结果是疏水基团埋藏在蛋白质分子内部,亲水基团暴露在分子表面。在形成分子疏水核心的同时,必然有一部分主链也被埋在里面。由于主链本身是高度亲水的,这样就产生矛盾。只有处于分子内部的主链极性基因(C=O,N—H)也被氨键中和,矛盾才能解决(分子表面的主链极性基团与溶剂水形成氨键)。正是在这种能量平衡中,蛋白质主链的折叠产生由氨键维系的有规则的构象,称为二级结构。
排阻极限
不能扩散进入凝胶珠微孔的最小分子的Mr,例如Sephadex G—50的排阻极限是30000。
酶活力的测定方法
通过两种方式可以进行酶活力测定,其一是测定完成一定量反应所需的时间,其二是测定单位时间内酶催化的化学反应量。测定酶活力就是测定产物增加量或底物减少量,主要根据产物或底物的物理或化学特性来决定具体酶促反应的测定方法。(1)分光光度法:利用底物和产物在紫外或可见光部分的光吸收的不同,选择一适当的波长,测定反应过程中反应进行的情况。这一方法的优点是简便、省时间和样品,可检测到nmol╱L水平的变化。该方法可以连续的读出反应过程中光吸收的变化,已成为酶活力测定中一种最重要的方法。几乎所有的氧化还原酶都可以用此方法测定。由于分光光度法有其独特的优点,因此把一些原来没有光吸收变化的酶反应,可以通过与一些能引起光吸收变化的酶反应偶联,使第一个酶反应的产物,转变成为第二个酶的
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