ITS在区分疑似黄鹌菜上的应用.doc

吉 首 大 学 JISHOU UNIVERSITY 2010届毕业论文 题 目： ITS在区分疑似黄鹌菜上的应用 学 生 姓 名： 余玉良 学 号 20064074006 学 院： 生物资源与环境科学学院 专 业 年 级： 06级生物科学（师范 ） 指 导 教 师： 恩特马克?布拉提白 写 作 时 间： 2010年5月 目 录 摘 要 ………………………………………………………………………………………………….1 关键词……………………………………………………………….….………………………………...1 Abstract………...………………………………………………...……………………………………….1 Key words………………………………………………………………………………………………….2 前言 ………………………………………………………………..………………………………….2 1材料和方法：……………………………………………………………………………………………3 1.1 材料….………………..……………………………………………………………………………….3 1.1.1 材料来源………………………………………………………………………………………….3 1.1.2 主要试剂………………………………………………………………………………………….3 1.2 方法………………….……………………………………………………………………………….3 1.2.1 实验材料的采集、洗涤与称量………………………………………………………………….3 1.2.2 样品总DNA的制备……………….…………………………………………………………….3 1.2.3 样品rRNA基因ITS序列PCR扩增.………….……………………………………………….4 1.2.4 ITS序列分析…………………………………………………………………………………….4 2 实验结果………..…………………………………………………………………………………….4 2.1.黄鹌菜和异叶假福王草总DNA的制备…………………………………………………………….4 2.2 ITS序列扩增结果…….…………………………………………………………………………….5 2.3 序列及结构分析结果…..…………………………………………………………………………….5 2.4 同源性分析………….……………………………………………………………………………….7 3 讨论……………..…………………………………………………………………………………….8 参考文献..………………………………………………………………………………………………….9  吉首大学毕业论文  PAGE 10 ITS在区分疑似黄鹌菜上的应用 作者：余玉良 指导老师：恩特马克·布拉提白 （吉首大学生物资源与环境科学学院 中国吉首416000） 摘 要：本研究通过ITS序列对四种菊科植物进行了同源性分析。首先采用改良CTAB法提取总DNA，利用通用引物ITS5和ITS4）经PCR扩增出ITS序列并进行测序。在NCBI数据库中对测序结果进行同源性比对，调取同源性较高的ITS序列，通过聚类分析软件构建进化树。结果表明,四组样品5.8S rDNA序列显示高度的一致性。多态性位点大部分分布于ITS1和ITS2中，且ITS1中的多态性位点高于ITS2。基于ITS序列的系统发育树表明，聚类分析结果与形态学分类结果一致，说明ITS可以作为菊科植物种属、居群间的聚类分析指标。 关键词：菊科；福王草；黄鹌菜；PCR；ITS序列 Aplication of ITS on Distinguishing Seeming Youngia japonica YU Yu-liang Supervisor: Entomack Borrathybay (College of Biology and Environmental Science， JiShou University， JiShou， China， 416000) Abstract: Homology analysis of ITS Sequences from Paraprenanthes prenanthoi