- 1、本文档共17页,可阅读全部内容。
- 2、有哪些信誉好的足球投注网站(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
2014基因组学最终版
基因组学题库
一 基因组学介绍
1 基因组与基因组学
基因组是指生物的整套染色体所含有的全部DNA序列,是生物体所有遗传信息的总和。
基因组学(Genomics)是以生物信息学分析为手段研究基因组的组成、结构、表达调控机制和进化规律的一门学科,研究对象是基因组结构特征、变演规律和生物学意义。
2 C质与C质悖论
C值(C value)通常是指某一生物单倍体基因组DNA的总量。
C值悖论(C Value Paradox):生物的复杂性与基因组的大小并不完全成比例增加。
3 人类基因组计划及其8个目标
人类基因组计划(human genome project, HGP)是由美国科学家于1985年率先提出,于1990年正式启动的。美、英、法、德、日和我国科学家共同参与了这一预算达30亿美元的人类基因组计划。按照这个计划的设想,在2005年,要把人体内约10万个基因的密码全部解开,同时绘制出人类基因的谱图。其8个目标:1)人类DNA序列(Human DNA sequence);2)开发测序技术(Develop sequencing technology);3)识别人类基因组序列变异(Identify human genome sequence variation);4) 功能基因组学技术(Functional genomics technology);5)比较基因组学(Comparative genomics);6) 伦理、法律、社会问题(ELSI: ethical, legal, and social issues);7)生物信息学和系统生物学(Bioinformatics and computational biology);8)Training and manpower。
4 什么是宏基因组(metagenomics)?
研究一类在特殊的或极端的环境下共栖生长微生物的混合基因。生境中全部微小生物遗传物质的总和。它包含了可培养的和未可培养的微生物的基因,目前主要指环境样品中的细菌和真菌的基因组总和。
二 数据库介绍
1 GenBank一级数据库和二级数据库
一级数据库:是指由实验的原始数据构成,不进行任何的处理,其内容由提交者控制。如Genbank,SNP,GEO。
二级数据库:是指基于一级数据库建立的, 对生物学知识和信息的进一步整理,内容由第三方(NCBI)控制,如Refseq,TPA,Unigene。
2 refSeq和Havana基因集
RefSeq会为收录的最优典型序列提供一个专业的拉丁文收录号,该序列是非冗余的,高质量的,经检验校正的序列信息;RefSeq记录了目前关于一个基因和它的转录子的知识的汇编,它们很多都来自于GenBank记录、人类基因组命名委员会、和OMIM,RefSeq标准为人类基因组的功能注解提供一个基础。
Havana是人和动物基因组注释数据库,提供人工注释的人类、小鼠、斑马鱼以及其他脊椎动物的基因组,可以在 Vega 浏览器上有哪些信誉好的足球投注网站到,由sanger实验室团队通过人工方法提供更加准确和全面的基因组注释信息,包括剪接变异体、假基因、基因复制和非编码基因。Havana基因集特别强调剪切变体和假基因,还有多聚腺苷酸化的特征。很多Havana中的转录本被注释为不存在编码区,这些转录产物可能作为非编码RNA或者它们可能是目前无法确定的一个编码基因的不完全片段。
3 UCSC genome browser 是什么类型数据库,提供哪些基因组学研究资源
UCSC GENOME BROWSER是二级数据库,给浏览基因组数据库提供了可靠和迅速的方式。约有一半的注释信息是UCSC通过来自公开的序列数据计算出来的,另一半是来自世界各地的科学工作者。本身并不下任何结论,而只是收集各种相关信息供用户参考。支持数据库检索和序列相似性有哪些信誉好的足球投注网站。
UCSC Genome Browser 是由 UCSC 创立和维护的,该站点包含有人类、小鼠和大鼠等多个物种的基因组草图,并提供一系列的网页分析工具。站点用户可以通过它可靠和迅速地浏览基因组的任何一部分,并且同时可以得到与该部分有关的基因组注释信息,如已知基因,预测基因,表达序列标签,信使 RNA,CpG岛,克隆组装间隙和重叠,染色体带型,小鼠同源性等。用户也可以因为教育或科研目的加上他们自己的注释信息。UCSC Genome Browser 目前应用相当广泛,比如 Ensembl 就是使用它的人类基因组序列草图为基础的。
三 遗传图谱
1 遗传图谱和作图原理
遗传图是应用遗传学分析方法将基因或其他DNA分子标记标定在染色体上构建的连锁图,也叫遗传连锁图 (genetic linkage map) 。这一方法包括杂交实验,家系分析等。遗传图距单位为厘摩(cM ),每单位厘摩定义为1%交换率。
您可能关注的文档
- 2013高考语文作文必威体育精装版素材海燕体.doc
- 2013高考语文作文必威体育精装版素材材料作文“路人”导写.doc
- 2013高考真题分类解析理综(2物质的量与化学计算).doc
- 2013高考风向标文科数学一轮课时知能训练第1章第3讲简单的逻辑联结词.doc
- 2013麒麟高中高一化学精品练习单元质量评估(四)(必修2).doc
- 2013高考试题分类汇编13地理环境与区域发展.doc
- 2013黑龙江驾校一点通考试C1小型手动档汽车试题.doc
- 2014(春)计算机控制技术期中考试(答案).doc
- 2014-2015学年高中生物专题四课题3酵母细胞的固定化知能提升新人教版选修1.doc
- 20140104更新m3新题+心得.doc
最近下载
- 2024年大数据技术试题库(含答案).pdf
- 艾兰德ALD6000P系列变频器使用手册(中文).pdf
- NB∕SH∕T 0944.2-2020 润滑剂抗磨损性能的测定 FE8滚动轴承磨损试验机法 第2部分:润滑脂.pdf
- 四川大学2020年11月课程考试考试《103014电子商务》参考答案.doc
- 廉洁案例教育(廉洁党课)-1.ppt VIP
- 游泳馆突发紧急事件处理预案.doc
- 国开(中央电大)专科《财务管理》网上形考(任务一至四)试题及答案.docx
- 我的教育教学故事(荟萃20篇).docx VIP
- 部编版小学语文六年级上册期中考试试卷(含答案).doc
- 数学北师大版五年级上《比较图形的面积》说课课件.pptx
文档评论(0)