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2008适配子
中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology,2008,28(1):113~118
适配子筛选技术
张慧卿 方 念 张和
(南昌大学第一附属医院 江西省消化疾病研究重点实验室 南昌 330006)
摘要 适配子的筛选技术近年来不断改良与发展。结合核酸与游离核酸的分离技术的改良,使
适配子筛选效率得到提高;无引物结合部位适配子的筛选技术的建立和短寡核苷酸文库的应用,
使适配子的应用范围更加广泛;适配子筛选技术在功能上的拓展,满足了更多的研究要求。一系
列新方法的建立和应用,使适配子在基础研究和临床应用方面更具潜在价值。
关键词 适配子 SELEX技术
中图分类号 Q819
??配子(aptamer)即能与靶分子高特异性、高亲和 (ssDNA)文库,寡核苷酸链中间为长度 30~60nt的随
力结 合 的 寡 核 苷 酸 配 基,系 通 过 SELEX(systematic 机序列,两端为 20~40nt的固定序列,可根据需要在 5′
evolutionofligandsbyexponentialenrichment)技术从人 端加上 T7RNA聚合酶启动子序列。同时设计一对相
工合成的大容量单链随机寡核苷酸文库中筛选并富集 应的 PCR引物,上游引物序列与寡核苷酸的 5′端固定
而得。文库中 的 寡 核 苷 酸 单 链 存 在 随 机 序 列,通 过 序列相同,下游引物与 3′端固定序列互补。将合成的
WatsonCrick碱基配对原则和分子内交互作用,每一条 原始文库与靶分子孵育,过滤分离出靶分子核酸复合
核苷酸单链均可有不同的三维结构,如发夹(hairpin)、 物,洗脱下核酸并进行 PCR扩增得到 dsDNA文库,再
假结(pseudoknot)、凸环(bulge)、G四聚体(Gtetramer) 进行链分离或不称 PCR扩增得到 ssDNA亚文库,或进
15
等。由于筛选文库的容量巨大(可达 10 左右),因此 行转录得到 RNA亚文库。将亚文库再与靶分子孵育、
理论上应用 SELEX技术能筛选到自然界几乎所有靶分 分离、洗脱核酸并 PCR扩增,得到新的亚文库,再进行
子的适配子。适配子的作用有如抗体,但它在敏感性、 第二轮筛选。重复进行上述筛选 /扩增步骤,直至与靶
特异性方面有时优于抗体,并且其靶分子更广泛,性质 分子结合的核酸比例不再升高时终止,此时得到的最
更稳定,制备更简单,无批间差异,因此具有良好的应 后一轮筛选亚文库即为适配子文库。对适配子文库进
用价值,近年来在基础研究、药物开发、临床应用等方
行克隆、测序,制备单一适配子。鉴定各适配子与靶分
面的研究报道不断增多,同时,其筛选技术本身也得到
子结合的特异性和亲和力,优选出有价值的适配子,人
不断发展,适用性、简便性不断改善。本文就适配子筛
工合成供研究应用。
选技术方面的进展作一综述。
2 SEL
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