及其在水稻功能基因组研究中的应用.pdf

高技术通讯 $##)= ( 转座子标签法及其在水稻功能基因组研究中的应用 ! 黄坤艳! !! 饶力群! 储成才#!! （!湖南农业大学理学院 长沙 !#$%） （!!中国科学院遗传与发育生物学研究所 北京 ###） 摘 要 综述了转座子标签法的研究进展及其在水稻功能基因组研究中的应用。 关键词 转座子标签法，功能基因组，水稻 等［(］。此外它也不仅局限于单一的插入突变，通 引 言 # 过对 *+,-. 左右边界之间部分的修饰还发展出基 因捕捉、启动子捕捉和激活标签等多种策略。然而 测序工作完成后，水稻基因组的研究重点已转 *+,-. 标签法也有它的不足之处：第一， *+,-. 移到了功能基因组上。据估计水稻基因组中约有 插入往往伴有插入位点处的缺失、倒位、重复等突 ### ’ (#### 个基因，要逐一弄清它们的功能， 变，影响结果分析。第二， *+,-. 插入并不都是 工作量远比测序大得多。根据表型及其遗传规律确 单拷贝的。多拷贝分散甚至几个 *+,-. 正向或反 定基因在染色体上的位置，并测定其序列，称为正 向连接成一体插入植物基因组，不仅给分子分析带 向遗传学，而根据已知序列研究基因功能，称为反 来不便，在基因捕捉和启动子捕捉时还会造成报告 向遗传学。在植物中，反向遗传学方法主要有三 基因的错误表达。第三，工作量大。理论上要达到 种：基因替代、基因沉默和插入突变［］，它们都 23的概率使基因组中每一个基因均因插入而??突 是首先对基因进行破坏或突变，分析表型或生理变 变，所需突变体数量至少应为基因总数的 倍左 化，进而确定基因功能。通过基因重组进行的基因 右。据此，水稻饱和 *+,-. 插入突变体至少在 替代在拟南芥和水稻中证明是可行的［$，)］，但效率 )##### 以上。第四， *+,-. 插入还受到寄主的限 太低，不适合大规模功能基因组分析。正向和反向 制，只适用于建立有完善转化系统的植物，那些转 抑制 引 起 基 因 失 活 的 方 法 也 被 用 来 研 究 基 因 功 化困难及不能转化的种类则被排除在外。转座子则 能［!，］，由于其对一个基因的研究需要几个乃至几