常见致病性真菌核糖体RNA基因分子鉴定.pdfVIP

? 138 ? 中华传染病杂志 2013 年 3 月第 31 卷第 3 期 Chin J Infect Dis , March 2013 , Vol. 31 , No. 3 ·基础论著· 常见致病性真菌核糖体 RNA 基因分子鉴定 王璇李莉王睿莹吴吉芹胡秀平徐斌曹亚辉幸强强朱利平翁心华 E 摘要】 目的 评价核糖体 RNA 基因 (rDNA) 分子鉴定用于常见致病性真菌鉴定的准确性。 方法 选取致病性酵母类真菌、丝状真菌和无绿藻共 60 株，其中包括 13 株标准菌株和 47 株临床/ 环境分离株，分别对其进行表型鉴定和 rDNA 分子鉴定，包括内转录间隔区 1CITS l)、内转录间隔区 2CITS2) 及 28S 亚基 rD~A5 端的 D l/ D2 区(Dl /D2) 靶序列的测定与比对，比较表型鉴定及单个、多 个 rDNA 靶序列分子鉴定的准确率。结果 在 23 株酵母类真菌分离菌株中，Dl /D2 分子鉴定准确 率最高 (20/23.87.0%). 而后依次为 ITS1 联合 ITS209/23 ,82. 6 %)、单用 ITS208/23 ， 78.3%) 、单 用 ITS1 (l 4/23.60. 9%); 在 22 株丝状真菌分离菌株中 .ITS1 联合 ITS2 分子鉴定准确率最高 06/22. 72.7% )，而后依次为 ITS1 (15/22. 68.2%) 、 ITS2 (14/22. 63. 6 %)、Dl /D2 (13/22. 59. 1 %)。而 ITS1 、 ITS2 、Dl /D2 三者线性联合鉴定准确率更高，可准确鉴定 9 1. 3% (21/23) 的酵母类真菌分离菌 株和 72.7%06/22) 的丝状真菌分离菌株。结论 rDNA 分子鉴定应用于常见致病性真菌的鉴定准 确率高，尤其是 ITS 联合 D l/ D2 具有较好的应用前景。 E 关键词】 真菌; RNA. 核糖体;基因，真菌;序列分析 .DNA Ribosomal RNA gene molecular identification of common pathogenic fungi WANG Xuαη ， LI Li , WANG Rui-ying. WU li-qin , HU Xiu 户 ing. XU Bin. CAO Ya-hui. ZHANG Qiang-qiang. ZHU Li- ρ ing. WENG Xin-hua. Department of lnfectious Diseases. Huashan Hospital. Fudan University , Shanghai 200040. China Corresponding author: ZHU Li 户 ing. Email:zhulp@ [Abstract Objective To evaluate the accuracy of ribosomal RNA gene (rDNA) molecular identification in identification of common pathogenic fungi. Methods Sixty pathogenic fungi including yeasts. filamentous fungi and Prototheca species were included in the study. among which 13 were reference strains and 47 were clinical/ environmental isolat