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5_1距离与相似系数
第五章 ;一、聚类分析的基本思想及意义; 聚类分析的基本思想是在样品之间定义距离,在变
量之间定义相似系数,距离或相似系数代表样品或变量
之间的相似程度。按相似程度的大小,将样品(或变量)
逐一归类,关系密切的类聚集到一个小的分类单位,然
后逐步扩大,使得关系疏远的聚合到一个大的分类单位,
直到所有的样品(或变量)都聚集完毕,形成一个表示
亲疏关系的谱系图,依次按照某些要求对样品(或变量)
进行分类。;;聚类分析与判别分析的区别与联系;二、样品间的相似性度量——距离;设;聚类分析中常用的距离;绝对距离; 以上距离与各变量指标的量纲有关,为消除量纲的
影响,有时应先对数据进行标准化,然后用标准化数据
计算距离。标准化数据;马氏距离;三、变量间的相似性度量——相似系数;相关系数;变量; 变量聚类通常称为R型聚类。在R型聚类中,相似矩
阵; 有时变量之间也可以用距离来描述它们的接近程度.
距离和相似系数之间可以相互转化。
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