（Molecular Biology）分子生物学 9.pptVIP

* * * * * * * * * * * * Cys:半胱氨酸； Phe：苯丙氨酸； Leu：亮氨酸；His：组氨酸 * Glucocorticoid:糖皮质激素 Estrogen:雌激素 Gly: 甘氨酸； Ser: 丝氨酸 glu:谷氨酸 * 果蝇的触角足转录因子 * * * * * * * 2. 转录因子需要担负不同的功能，如与顺式元件结合，激活转录，亚基间的聚合等。不同的功能由不同的结构域承担。 3. 不同转录因子功能相当的结构域可以互换，而不致影响其它结构域的功能。 DNA结合结构域 激活结构域 连接域 五、转录因子的结构域 4. DNA结合结构域 锌指结构域: 在锌指结构域中有一组与锌原子结合的保守氨基酸。一个锌指蛋白通常包含几个串接在一起的锌指。 C2H2锌指 经典锌指蛋白结构：每个锌指包括23个氨基酸，锌指间由7-8个氨基酸连接。单个锌指的保守氨基酸序列：Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X3-His。 五、转录因子的结构域 C2H2型锌指通过两个半胱氨酸和两个组氨酸残基固定，一般要有三个或更多个C2H2锌指串接在一起才能与DNA结合。 五、转录因子的结构域 b) C4 (Cys2/Cys2) 锌指 主要存在于类固醇激素受体转录因子中。这些转录因子由同型或异型的二聚体组成，其中每一单体包含两个C4锌指结构。 共有序列：Cys-X2-Cys-X13-Cys-X2-Cys 两个锌指，一个用于与DNA结合，一个用于二聚化。 4. DNA结合结构域 2) 螺旋-转角-螺旋结构域 (helix-turn-helix, HTH) 该结构域主要包括两个α-螺旋区和将其隔开的β转角。其中的一个α螺旋区被称为识别螺旋区，因为它常常带有数个直接与DNA序列相识别的氨基酸。识别螺旋区主要与DNA的大沟相结合。 五、转录因子的结构域 4. DNA结合结构域 3) 碱性结构域 很多转录因子含有碱性结构域，而且通常与二聚体结构域如亮氨酸拉链(ZIP)或螺旋-环-螺旋(HLH)联系在一起。 这类转录因子被称为碱性亮氨酸拉链（bZIP）或碱性HLH蛋白（bHLH）。 五、转录因子的结构域 4. DNA结合结构域 在一些转录因子DNA结合结构域的C-端，有一段氨基酸基序，其中每七个氨基酸中有一个亮氨酸。 亮氨酸拉链形成一个两性双螺旋，其中疏水的亮氨酸与另一蛋白的亮氨酸拉链相互作用形成二聚体。 形成二聚体后，两个蛋白N-端的碱性结构域形成一个对称结构与DNA结合。 五、转录因子的结构域 4) 亮氨酸拉链 (leucine zipper, ZIP) d) 亮氨酸拉链既可以存在于同源二聚体中，也可以存在于异源二聚体中。 4. DNA结合结构域 在有些转录因子DNA结合结构域的C-端有一个二聚体结构域，其保守结构是一段由40-50个氨基酸形成的两个螺旋区，其间被一个环 (loop) 分开。 五、转录因子的结构域 ------5) 螺旋-环-螺旋 (HLH) b) 两个蛋白相对应的?螺旋区的疏水残基相互作用形成二聚体。 c) 有组成型表达的bHLH蛋白，也有组织专化表达的bHLH蛋白。 d) 非碱性的HLH蛋白可以通过和bHLH蛋白聚合，抑制基因表达 亮氨酸拉链和螺旋-环-螺旋都属于二聚体结构域。 5. 转录激活结构域 转录激活结构域一般由20-100个氨基酸残基组成。如GAL4分子中有2个这种结构域，分别位于多肽链的第147-196位和第768-881位；GCN4的转录激活结构域位于多肽链的第106-125位。 1) 酸性激活结构域 2) 富含谷氨酰胺结构域 3) 富含脯氨酸结构域 五、转录因子的结构域 5. 转录激活结构域 酸性激活结构域： 该结构域含有由酸性氨基酸残基组成的保守序列，多呈带负电荷的亲脂性?-螺旋，包含这种结构域的转录因子有GAL4、GCN4、糖皮质激素受体和AP-1/Jun等。 增加激活区的负电荷数能提高激活转录的水平。 可能是通过非特异性的相互作用，与转录起始复合物上的TFIID等因子结合生成稳定的转录复合物而促进转录。 五、转录因子的结构域 2) 富含谷氨酰胺结构域：例如：SP1 SP1的N末端含有2个主要的转录激活区，氨基酸组成中有25%的谷氨酰胺，很少有带电荷的氨基酸残基。酵母的HAP1、HAP2和GAL2及哺乳动物的OCT-1、OCT-2、Jun、AP2和SRF都含有这种结构域。 3) 富含脯氨酸结构域： CTF家族（包括CTF-1、CTF-2、CTF-3）的C末端与其转录激活功能有关，含有20%-30%的脯氨酸残基。 五、转录因子的结构域 本章重点、难点： 1、概念：转录因子、增强子、 锌指结构域、启动子元件 2、真核生物RNA聚合酶的种类及特征。 3、RNA聚合酶II