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加速海啸模拟.PDF
设计解决方案
加速海啸模拟
作者:日本东北大学副教授 Kentaro Sano
挑战
海啸模拟将物理过程模拟与大量深海数据相结合。这些计算通常在大规模并行超级计算
机上完成,但具有硬件利用率低和性能差的缺陷。
解决方案
通过硬件浮点 FPGA 加速模拟内循环可实现高达 383 GFLOPS 的性能,能效超过 8.4
†
GFLOPS/瓦 。
项目
设计团队
我们需要高性能且低功耗的计算解决方案,以借助真实的深海数据集来执行海啸模拟。
Sano 教授就职于日本东北大学(日本仙 这需要在有限的外部内存带宽下,实现有效计算并高效利用浮点运算单元。
台)计算机与数学科学系,主要从事并行
模拟工作使用人们所熟知的浅水方程组,这是一组偏微分方程,描述流体流动对压力波
可重构计算方面的研究。他的团队通过应
的响应。我们提供实际测深数据(靠近海岸时测得的有关海洋的深度信息)作为求解程序
用 FPGA 和 GPU 来加快解决要求严苛的
的输入值。
物理问题。
设计挑战
海啸模拟通常使用具备多核处理器与众核加速器(如图形处理单元 (GPU ))的超级
计算机来执行。通过计算节点上的大量芯片上内核,基于软件的并行计算可实现高性
能模拟。
但此类基于软件的大规模并行计算通常受到内存带宽不足的限制,效率非常低,尤其是
在具有低运算密度的算法中,问题极为突出。运算密度是指运算数量与必须从外部内存
加载的数据量之比,表示为每单元数据大小执行的运算数量,通常为 FLOP/字节。由于
每个处理器具有固有的峰值运算性能 (GFLOPS )与可用外部内存带宽(每秒千兆字节
(Gbps ))之比,因此当算法的运算密度较低时,可持续性能通常受到内存带宽的限制。
因此,在计算内核性能、性能功耗比和性能价格比方面,此类内存受限计算的效率非常
低。虽然有一些技术可提高部分特定算法的运算密度,如旨在提高缓存内存中数据重用
效率的时间阻塞等,但是从根本上来说,CPU 或 GPU 的固定内存子系统不支持在芯片
上的内核之间实现理想的数据移动。例如,即使我们应该直接将数据从一个内核移动到
另一个内核,CPU 和 GPU 也需要从共享缓存内存读取/写入数据,或将数据读取/写入
至共享缓存内存。
设计解决方案 | 加速海啸模拟
设计解决方案 我们根据深度流水化和粗粒度并行性,通过 FPGA 为高性能海
啸模拟设计定制计算单元,并在芯片上实现性能可扩展性。通过
海啸模拟的计算表示为有限差分算法的模板计算(stencil
流水化,在每次访问内存时,我们可以执行大量运算,在此基础之
computation)
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