- 1、本文档共8页,可阅读全部内容。
- 2、有哪些信誉好的足球投注网站(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 5、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 6、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 7、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 8、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
转录本组装与质量评价.PDF
生 物 工 程 学 报 邓飞龙 等/转录本组装与质量评价 1271
Chinese Journal of Biotechnology
/cjbcn September 25, 2015, 31(9): 1271−1278
DOI: 10.13345/j.cjb.140508 ©2015 Chin J Biotech, All rights reserved
综 述
转录本组装与质量评价
邓飞龙,贾先波,赖松家,刘益平,陈仕毅
四川农业大学 畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室,四川 成都 611130
邓飞龙, 贾先波, 赖松家, 等. 转录本组装与质量评价. 生物工程学报, 2015, 31(9): 1271–1278.
Deng FL, Jia XB, Lai SJ, et al. Transcript assembly and quality assessment. Chin J Biotech, 2015, 31(9): 1271–1278.
摘 要: 转录本组装是基于第二代测序技术研究转录组的关键环节,其质量好坏直接影响到下游结果的可靠性,
也是目前的研究热点与难点。转录本组装方法可以分为Genome-guided 和de novo 两类,它们在理论基础与算法实
现方面各有优劣。转录本组装质量的高低依赖于PCR 扩增错误率、第二代测序技术准确率、组装算法和参考基因
组完整性等方面,而现有的算法还无法完全处理由这些因素带来的影响。本文从转录本组装方法与软件、影响组装
质量的因素和对组装质量的评价指标等方面进行讨论,以期能指导纯生物学家对分析软件的选择。
关键词: 转录组,第二代测序,组装软件,转录组测序
Transcript assembly and quality assessment
Feilong Deng, Xianbo Jia, Songjia Lai, Yiping Liu, and Shiyi Chen
Farm Animal Genetic Resources Exploration and Innovation Key Laboratory of Sichuan Province, Sichuan Agricultural University,
Chengdu 611130, Sichuan, China
Abstract: The transcript assembly is essential for transcriptome studies from next-generation sequencing data. However,
there are still many faults of algorithms in the present assemblers, which should be largely improved in the future.
According to the requirement of reference genome or not, the transcript assembly could be classified into the
genome-guided and de novo methods. The two methods have different algorithms and implementation processes. The
quality of assembled transcripts depends on a large number of factors, such as the PCR amplificati
您可能关注的文档
- 跳舞要跳_人_赞于晓雪的表演.pdf
- 跳跃高手.ppt
- 身份认同导论.pdf
- 身体和嘴巴总有一个在路上.PDF
- 身体状况调查表-平面、绳索课程.PDF
- 车位引导系统施工工艺.pdf
- 车库门开门机.PDF
- 车标大全(精心编辑).pdf
- 车用尿素溶液的运输储存要求.pdf
- 车载油箱压力检测相对压力传感器.PDF
- 复习专题一 人体的内环境与稳态(课件)高二生物上学期期末考点(沪科版2020).pptx
- 5.2.3 简单复合函数的导数(课件)高二数学选择性必修第二册(人教A版2019).pptx
- 8.1 日益重要的国际组织(课件)-高二政治(统编版选择性必修1).pptx
- 第25课 中华人民共和国成立和向社会主义的过渡(课件)高一历史课件(中外历史纲要上册).pptx
- 高三一轮复习课件 第2章地球上的大气 第6讲大气的运动.pptx
- 第13课 当代中国的民族政策 课件 高二上学期历史统编版(2019)选择性必修1国家制度与社会治理.pptx
- 3.2推动高质量发展(核心知识课件)高一政治课件(统编版必修2).pptx
- 4.1常见的地貌类型 课件 高中地理人教版(2019)必修一.pptx
- Unit 3 Food and Culture Using Language Reading for Writing 课件-高二英语人教版(2019)选择性必修第二册.pptx
- 2.2.2大气受热过程和大气运动课件 高一上学期 地理 人教版(2019)必修1.pptx
文档评论(0)