四种不同QTL作图方法的比较研究.pdfVIP

第31 卷 第 11期 作 物 学 报 Vol13 1, No1 11 2005 年 11 月 1473~ 1477 页 ACTA AGRONOMICA SINICA pp1 1473- 1477 Nov1, 2005 QTL 李杰勤 张启军 叶少平 赵 兵 梁永书 彭 勇 吴发强 王世全 李 平* X ( 四川农业大学水稻研究所; 四川省农业生物技术工程研究中心, 四川温江611130) : 应 区间作图法(IM) 、复合区间作图法(CIM) 、基于混合线性模型的复合区间作图法(MCIM) 和多重区间作图法 (MIM) 对水稻杂交组合(培矮 64 @ 日本晴) F 群体株高性状进行了QTL 作图分析。结果表明, ( 1) 在同一显著水平下 2 (A= 010023) , 4 种方法共发现 10 个QTL , 其中IM 法7 个, CIM 法 10 个, MCIM 法3 个, MIM 法 1 个。CIM 法的发现能力最 强。(2) CIM 法发现了IM 法发现的全部QTL , 和左端标记的距离也基本一致。(3)4 种方法检测到了同一QTL, 且共同检 测到QTL 的贡献率最大。(4)4 种方法估计的QTL 的平均加性效应 ¿和显性效应…d 无显著性差异, 同一QTL 在显性效应 的方向上表现一致。( 5) 建议使 多种作图方法共同作图, 并优先标定共同发现的QTL。 : QTL 作图; IM 法; CIM 法;MCIM 法; MIM 法 : S511 Comparative Research on Four Mapping Methods of QTLs LI Jie2Qin, ZHANG Qi2Jun, YE Shao2Ping, ZHAO Bing, LIANG Yong2Shu, PENG Yong, WU Fa2Qiang, WANG Shi2Quan, LI * Ping ( Rice ResearchInstitute, SichuanAgricultural University; Sichuan Provincial Centerfor Agri2Biotech Research, Wenjiang 611130, Sichuan, China) Abstract: Four mapping method , the interval mapping( IM) , the compo ite interval mapping( CIM) , the mixed compo ite interval mapping(MCIM) and the multiple interval mapping( MIM) , were employed to detect the quantitative trait loci (QTL) of rice plant height with an F data from the intercro PA64 @Nipponbare1 The re ult were a follow : ( 1) 7 2 ignificant QTL were detected by IM, 10 QTL by CIM, 3 QTL by MCIM, 1 QTL by MIM for the trait at the ame ignificant level1 So CIM had the highe t detective capability among the four method 1 ( 2) The loci detected by IM were al o detected by the method of CIM, and aiming at the ame QTL, their di tance to