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一种新型的具有“质谱标签”转移功能的光交联探针.pdf
物理化学学报(阶J!i Huaxue Xuebao)
September Acta Phys. -Chim. Sin. 2016, 32 (9), 2 125 - 2126 2125
[Highlight] doi: 10.3866IPKU.WHXB20 1608081
一种新型的具有质谱标签转移功能的光交联探针
艾辉旺
(Department ofChemistry. University ofCa/.仲rnia Riverside. 501 Big Springs Road. Riverside. CA 92521. USA)
DiZHSeC
UV I
365 nm I I
I I MS-Iabel
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J吁μ-(
prey
信息l 。
蛋白质-蛋白质相互作用贯穿于整个生命进
程,对其进行研究是生命科学领域的重点, 并极 发展多功能探针可以帮助解决这些问题, 陈
具挑战性。光交联技术己经成为活体研究蛋白质一 鹏课题组通过对第一代探针DiZPK 结构进行改
造,在探针主链上引入可以通过氧化断裂的碳·确
臼质相互作用的一项有力工具九尤其是位点特异
性的光交联技术,其利用遗传密码子扩增技术将 键,开发了一种可切割的光交联探针DiZSeK。该
光交联探针引入到目的蛋白的特定氨基酸位点 探针可以排除诱饵蛋白对鉴定造成的干扰并在一定
上』 ,可以在活细胞内实现实时高效地捕捉与诱饵 程度上降低了鉴定的假阳性率。该工作于2014 年发
蛋白相互作用的底物蛋白。 表在Journal 01theAmerican Chemical Society上飞
北京大学化学与分子工程学院陈鹏课题组开 最近, Nature Communications 上刊登了陈鹏
发了一种能在极端条件下(如胃酸环境)活体捕捉蛋 课题组与北京大学化学与分子工程学院王初课题
白质相互作用的光交联探针DiZPK。该工作于 组的相关研究工作。 该团队进一步对探针DiZPK
2011 年发表在Nature Chemical Biology 上飞然而 的结构进行改造,开发了一种含有可转移质谱
这类光交联探针性能单一,其后续处理只能延续 标签的光交联探针DiZHSeC。该探针在交联到
传统的亲和纯化步骤,不可避免的会引入非 底物蛋白后,可以通过氧化切割发生断裂, 从而
特异性吸附以及非直接相互作用的蛋白,从而造 实现诱饵蛋白与底物的分离并在底物蛋白上
成较高的假阳性鉴定飞另一方面,交联获得的交
原位产生稳定的质谱标签。通过该质谱标
联肤段和交联位点包含着蛋白质-蛋白质相互作用
签,非特异性吸附的蛋白以及非直接相互作用蛋
界面的信息。然而利用
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