第1章基因与基因组药学本科-2012.ppt

基因诊断常用技术方法 ② 造成插入位点靶DNA的少量碱基对重复IS1、Tn10： 造成9bp的重复。 IS3： 造成3或4bp的重复。 IS4： 造成11bp的重复。 ④ 引起染色体畸变 在一个染色体上（甚至不同染色体上）若有同一转座子的两个拷贝，其提供的相同重组位点，可导致缺失、倒位、插入。 方向相同：产生缺失。 方向相反：发生倒位。 22个tRNA基因 人类基因组计划 1990年正式启动。 美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共同参与了这一价值达30亿美元的人类基因组计划。 计划旨在为30多亿个碱基对构成的人类基因组作图、精确测序，基因鉴定和功能分析，破译人类全部遗传信息 曼哈顿计划 阿波罗计划 思考题 基因和基因组的异同点？原核生物基因组和真核生物基因组各有哪些特征？ 何为重叠基因、断裂基因、假基因、跳跃基因、基因家族？ 何为卫星DNA序列？ 人类基因组计划的主要内容及其意义？ DNA分子标记：遗传图绘制需要应用多态性标志。 ——最早应用的标记是限制性酶切片段长度多态性（RFLP） ——到80年代后期应用短串联重复序列（short tandem repeat, STR）标记，又称微卫星（microsatellite,MS） ——第三代的多态性标记，即单个核苷酸多态性（ SNPs）标志近期被大量使用 限制性核酸内切酶 (restriction endonuclease) 限制性核酸内切酶(restriction endonuclease, RE)是识别DNA的特异序列, 并在识别位点切割双链DNA的一类内切酶。 Bam HⅠ GGATCC CCTAGG G CCTAG GATCC G + RFLP： restriction fragment length polymporphism 定义：由于内切酶切点变化所导致的DNA片段长度的差异，称为限制性片段长度多态性（RFLP） 碱基变异 ↓ 酶切点的消失或新的切点出现 ↓ 不同个体用同一限制酶切，DNA片段长度出现差异 限制性片段长度多态性RFLP 限制性片段长度多态性 RFLPs ( restriction fragment length polymorphisms) 样品一 样品二 1987年,H.Donis-Keller等人以RFLP为遗传标记绘制了第一张人类遗传图谱 限制性内切酶 DNA片段消化 RLFP分析法 微卫星DNA是一种广泛分布于真核生物基因组中的串状简单重复序列，每个重复单元的长度在1—10bp之间，不同数目的核心序列呈串联重复排列，而呈现出长度多态性,其重复次数在人群中是高度变异的。当用限制酶切割VNTR区时，只要酶切点不在重复区内，就可能得到各种长度不同的片段。 微卫星(STR) 主要位于非编码区，其核心单位的数目变化和重复次数不同， 构成了STR 的遗传多态性。 按孟德尔规律呈共显性遗传 。 据 Gene Bank 等数据库资料统计， 人类23 对染色体上至少分布着7901个STR位点， 仅性染色体上的已知位点数就在264个以上， 随着人们对STR 的进一步研究， 其数目还会不断增加， 迄今国外已分离了近万个STR ， 而国内只有少数报道。 STR 作为遗传标记有以下优点 ①在人类基因组中分布均匀， 因此可通过STR 对全基因组进行扫描; ②多态位点较为丰富; ③多态信息量较高。在每个STR 位点上， 多有几个或几十个等位片段; ④检测技术简便， 用PCR 扩增， 凝胶电泳分型， 或测序仪自动分型。 在法医学中的应用 上世纪90 年代早期， 在末代沙皇一家的遗骨鉴定中， 英国内务部成功地利用5个STR 位点对挖掘出来的75 年以前的尸骨进行了检测， 在DNA 含量仅有50 pg 或更少的情况下， 认定了9 付骨骼的性别及亲属关系。 如今， 随着DNA 分析技术的发展， STR 已经广泛应用于法庭科学中各类涉及有细胞的物证案件，包括个体识别、亲权鉴定、性别鉴定以及凶杀案、碎尸案、空难或其他灾难性事件中尸源认定等。 DNA指纹图谱分析 TAGA TAGA TAGA TAGA TAGA TAGA 1 2 3 4 5 SNPs：single nucleotide polymorphism 定义：指基因组DNA序列中由于单个核苷酸的突变而引起的多态性。 频率：人类DNA中约每300－1000个碱基中就有一个SNP 单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism， SN P) 虽然它的多