利用HPA-1~3, 5和15系统多态性估算中外不同人群遗传距离.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2008 年7 月, 30(7): 838―842 ISSN 0253-9772 研究报告 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2008.00838 利用HPA-1~3, 5 和15 系统多态性估算中外不同人群遗 传距离 1 1,2 1 1 1, 2 1 1 冯明亮 , 黄慧 , 沈彤 , 张晰 , 印彪 , 杨建豪 , 刘达庄 1. 上海市血液中心, 上海 200051; 2. 华东师范大学生命科学学院, 上海 200062 摘要: 依据血小板同种抗原 5 个系统的遗传多态性, 采用聚合酶链反应序列特异性引物技术, 对 1 000名中国汉 族无关献血者 HPA-1~3, 5 和 15 系统进行基因分型, 计算基因频率。使用 DISPAN 软件及 PHYLIP 软件计算不 同群体间遗传距离并绘制系统树。系统树显示, 亚洲人群先与欧洲人群相聚, 之后再与非洲人群相聚, 非洲人 群位于系统发生树的最顶部; 印度人群处于亚洲人群与欧洲人群之间; 南美洲巴西白人与欧洲人群聚在一起; 大洋洲的波利尼西亚人与亚洲人群聚在一起。此研究从一个侧面证明了人类“非洲起源说”, 印证亚洲人群由 南亚向东南亚再向东亚迁徙的路线, 并推断出欧洲人群由南欧向北欧、西欧迁徙的线路。HPA 能有效估算不同 人群间遗传距离, 分析人类迁徙过程, HPA 可作为遗传标记应用于人类进化的研究。 关键词: 人类血小板同种抗原; 遗传距离; 系统树 Estimating genetic distance and phylogenetic tree of HPA-1-3, 5, and 15 in different populations 1 1, 2 1 1 1, 2 FENG Ming-Liang , HUANG Hui , SHEN Tong , ZHANG Xi , YIN Biao , 1 1 YANG Jian-Hao , LIU Da-Zhuang 1. Shanghai Blood Center, Shanghai 200051, China; 2. School of Life Science, East China Normal University, Shanghai 200062,China Abstract: According to the human platelet alloantigens (HPA) polymorphisms in five systems, the distributions of HPA-1 -3, 5, and 15 systems in 1 000 Chinese donors were carried out by using a polymerase chain reaction with sequence-specific primers (PCR-SSP) method. The genetic distance and phylogenetic tree between Chinese Hans and other populations were estimated by using DISPAN and PHYLIP software. As presente