生物信息学导论-第1讲-第一章绪论-张高川.ppt

生物信息学第一章 绪论 张高川 生物信息学教研室 (Department of Bioinformatics) 基础医学与生物科学学院 (School of Biology and Basic Medical Science) 苏州大学医学部 (Medical College of Soochow University) Email: zhanggaochuan@ Tel:QQ: 2257916241 拓展阅读和实践练习 Thanks for your attention！ 带着问题来学习 生物信息学的解决方案和思路 生物学问题的提出 根据讲授的生物信息学的技术和方法: (1)理论知识 (2)数据库资源 (3) 分析工具 ? 生物学问题的解决 What to do ? (select a topic) What to do ? (select a topic) 百度百科： http:// / Preliminary Investigation – Background and Research Progress 维基百科： / Wikipedia： / PubMed： / Search of others databases: sub-databases of Genbank Entrez : / (Genbank) Select a research topic How to do ? How to do ? Comprehensive investigation Search/Query in various databases Data collection Systematic and integrated analysis 练习使用各种网络有哪些信誉好的足球投注网站引擎 进行专业知识开展自主学习 苏州大学 医学部 基础医学与生物科学学院 生物信息教研室 张高川（未经同意不得私自转载和发布） * 苏州大学 医学部 基础医学与生物科学学院 生物信息教研室 张高川（未经同意不得私自转载和发布） 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 什么是生物信息学？ 生命科学 信息学 数学 计算机科学 生物信息学的诞生和发展 生命科学研究的三重层次(1) 查尔斯·达尔文 (1809－1882) 生命科学研究的三重层次(2) 列文·虎克 (1632－1723) 生命科学研究的三重层次(3) 沃森和克里克 DNA双螺旋，1953 生命科学研究的三重层次(4) 现象 规律 理论 细胞 分子 生命的奥秘 个体 宏观 微观 规律 哲学 理论 ? 现代生命科学研究的一个大事件 人类基因组计划 (Human Genome Project, HGP) (30亿个碱基对) National Institutes of Health (NIH) 1990-2005； 30亿美元 国际人类基因组组织（HUGO） 美国能源部人类基因组计划徽标 英国、日本、法国、德国、中国、印度 1999年9月，中国正式加入HGP； 人类第3号染色体的短臂区域3000万个碱基对（1％）。 1998 1999 1998 美国科学家克莱格·凡特 塞雷拉基因组公司 (Celera Genomics) 2000.6.26, 克林顿 HGP-生物信息学发展和壮大的契机 人类基因组计划 (Human Genome Project, HGP) 30亿个碱基对 ? 基因组注释 新基因发现 基因组比较 数学方法 计算机技术 接下来，该怎么办？ 生物信息学的研究内容和方向 组学(Omics) 基因组学 转录组学 蛋白组学 代谢组学 生物信息学和系统生物学的技术和方法 药物研发 高通量技术和研究方法 数据挖掘 生物信息学的研究内容和方向(2) 1. 序列分析（Sequence alignment， databases） 2. 基因组注释（Gene finding） 4. 基因表达分析 （Microarray， SAGE） 6. 蛋白质表达分析 （2D PAGE，Mass spectrometry-MS） 5. 基因表达调控分析 （Promoter analysis， TFBSs，DNA methylation） 3. 计算进化生物学 、比较基因组学 9. 生物系统模拟 （Computational systems biology） 7. 结构生物信息学：蛋白质结构预测 、分子相互作用 8. 计算机辅助药物研发 11.肿瘤的组学分析 10.文献分析，文本挖掘（Text mining） 生物信息学在