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如何正确使用基因蛋白质的名称格式大写与斜体的使用).pdf
如何正确使用基因/蛋白质的名称格式(大写与斜体的使用)
1 一般规则
• 在你的文章中使用大家都认可的基因/蛋白质的名称和符号(见下文)
• 有时认可的基因/蛋白质的名称或符号已经不再有效。这种情况下,第一次提到的基
因/蛋白质,需要先列出经批准的名称,然后再添加括号说明( 以前被称为XXX) 。例
如,“我们使用抗POU5F1 蛋白的抗体( 以前称为OCT-4)...” 。注意使用正确的符号,
而不是以往的名称。
2 不同物种有不同的规则
1) 小鼠/ 大鼠/ 鸡
(1)一般命名规则(适用于小鼠,大鼠和鸡) :
• 基因的全名不用斜体,也不用希腊字母
例如:insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子1)
• 基因符号不用希腊字母和连字符,使用斜体,第一个字母大写,其余小写
例如:Igf1 (斜体)(胰岛素样生长因子1)
• 蛋白质的名称和基因符号相同,但不用斜体,并全部大写
例如:IGF1
• mRNA 和cDNA 的基因符号和规定的格式
例如:... levels of Igf1 (italicized) mRNA increased when...
• 首次提到的突变等位基因应该详细列出
例如:Igf1tm1Arge/Igf1tm1Arge (italicized) is one of several knockout alleles of Igf1 (italicized)
• 所有字母和数字用斜体,等位基因的符号(tm1Arge)要用上标
• 经前面详细描述之后,敲除的纯合子可表示为Igf1-/- (所有字母均用斜体,并且- / -
用上标) ;杂合子为Igf1 + / - 等。
(2)对于这些命名规定的详细信息,请参阅:
• (小鼠,大鼠,鸡) /
• (专门针对大鼠) /
• MGI 命名:/mgihome/nomen/index.shtml
• 基因的MGI 快速指南:
/mgihome/nomen/short_gene.shtml
2) 人类/非人类灵长类动物/家畜/ 除了小鼠、大鼠、鱼、昆虫、苍蝇外默认的其他物种
• 完整的基因名称不用斜体和希腊字母
例如:insulin-like growth factor 1(胰岛素样生长因子1)
• 基因符号不使用希腊字母和连字符,基因符号用斜体,所有的字母用大写
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例如:IGF1(斜体)
• 蛋白质的名称与基因符号相同,但不用斜体,并全部大写
例如:IGF1
• mRNA 和cDNA 的基因符号和规定的格式
例如:... levels of IGF1 (italicized) mRNA increased when...
更多关于此类物种基因(突变的等位基因)命名规则和符号的网站:
3) 鱼(适用于所有的鱼)
• 完整的基因名称用斜体表示,全部用小写字母,不要用希腊字母
例如:cyclops(斜体)
• 基因符号用斜体,全部小写
例如:cyc(斜体)
• 蛋白质命名与基因符号相同,但仅首字母大写,也不用斜体
例如:Cyc
更多关于此类物种基因(突变的等位基因)命名规则和符号的网站:
/cgi-bin/webdriver?MIval=aa-ZDB_home.apg
4) 其他有用的网站:
• ExPASy(特殊蛋白质分析系统) :是瑞士生物信息学研究所(SIB)提供的蛋白质组学服
务系统,可对蛋白质序列和结构以及二维PAGE 进行分析:( /)
• OMIM - 孟 德 尔 人 类 遗 传 学 数 据 库 :
(/entrez/query.fcgi?db=OMIM)
• NCBI – Entrez Gene :提供了一个按序列和/或在NCBIs Map Viewer 中查询基因的统
一环境。您可以查询名称,符号,加入,出版物,GO 条款,染色体数目,EC 号码,
和许多其他相关基因及它们的编码产物。 (/gene)
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