孟德尔分离群体验证候选基因遗传效应的策略.pdfVIP

畜牧兽医学报 2007，38(9)：989～992 ActaVeterinariaetZootechnicaSinica 孟德尔分离群体验证候选基因遗传效应的策略 姜润深 ，李俊英 ，杨 宁 (1．安徽农业大学动物科技学院，合肥 230036；2．中国农业大学动物科技学院，北京 100094) 摘 要：由候选基因法得到的基因变异一目标性状的关联性，其准确性和可靠性受群体遗传背景、连锁不平衡和样 本含量大小等因素的影响，所 以变异一性状关联性在某群体建立后，应进一步在其它群体中加 以验证。在存在低等 位基因频率的情况下，如果想得到一定数量低频率等位基因纯合子基因型个体的表型记录，就需要维持很大的试 验群体，且试验费用和工作量非常大。本研究提出了一个解决群体 内纯合子频率低的策略，即利用杂合子交配产 生孟德尔分离群，不但可以获得符合要求的群体规模，而且群体的遗传背景更为相近，同时可以充分考虑家系效 应，可以提高验证候选基因遗传效应的准确性。本研究以验证鸡垂体特异转录因子基因POU1F1—6位点对鸡生长 性状的遗传效应为例，表明此策略在低等位基因频率情况下验证候选基因遗传效应是可取的，且大大降低了工作 量和试验成本 。 关键词：孟德尔分离群；候选基因；遗传效应；验证；策略 中图分类号：Q346 ．2 文献标识码 ：A 文章编号：0366-6964(2007)09-0989—04 A StrategytoConfirm theGeneticEffectofCandidateGenein a JIANG Run—shen ，LIJun—ying。，YANGNing (1．CollegeofAnimalScienceandTechnology，AnhuiAgricultural University，Hefei230036，China；2．CollegeofAnimalScienceand Technology，ChinaAgriculturalUniversity，Beijing100094，China) Abstract Theaccuracyandthereliabilityoftheassociationbetweencandidategenevariationsand targettraitsareinfluencedby thegeneticbackgroundofpapulation，polymorphism ofgenes， linkagedisequilibrium ofQTLandthesamplesize．Theassociation，therefore，shouldbefurther confirmedinotherpopulations．However，forthegenewith low allelicfrequency，itislaborious andcost—consuming to develop alarge experimentalpopulation toprovideadequateindividuals with doubleminoralleles．Inthepresentstudy，a strategycrossingbetweenheterozygoteswas introduced togenerateaM endelian segregatingpopulationwith largersamplesizeoftheminor homozygousindividuals，andaccuracyofgenegeneticeffectevaluationwasenhancedduetothe closergeneticbackgroundandtheconsiderationoffamily information．Asan example，in this study．thegeneticeffectofthepituitary—specifictranscriptionfactorgene(POUIF1—6)onchick— a