对QTL复合区间作图法的一点改进.pdfVIP

第46卷 第 6期 武汉大学学报 (自然科学版) Vo1．46 No．6 2000年 12月 J．WuhanUniv．(Nat．Sci．Ed．) Dec．2000，766～ 768 文章编号：0253—9888(2000)06—0766—03 对QTL复合区间作图法的一点改进 胡 中 立 (武汉大学生命科学学院，湖北 武汉 430072) 摘 要：提出了“分子标记的遗传编码及其复合原则”，并构造出能够反映各级QTL互作效应的复合标记变 量x．，x．，…，x．；从理论上证明了各级复合标记变量与所有标记变量x。之间相互独立，并给出了各个复合标记 变量对数量性状y的偏回归系数的遗传学期望．基于这些理论结果，进而探讨了对复合区间作图的改进方案． 关 键 词：复合区间作图；分子标记；复合标记变量 ；上位性 中图分类号：Q348 文献标识码：A 数量性状座位 (quantitativetraitloci，QTL)的 以有相加式、相乘式等多种方式．为满足分析各级 区间作 图，最主要 的有两种，Lander和 Botstein 互作 QTL的 目的要求，我们特别提出分子标记的 (1989)提出的基于两个侧邻标记的区间作图(inter— 遗传编码及其复合原则：对于F。群体的AA，Aa，aa valmapping，IM)Eu，Zeng(1994)提出把多元线性回 分别赋值 1，0，一1(或一1，0，1)，对于加倍单倍体 归与区间作图结合起来的复合区间作图(composite (doubledhaploid，DH)和重组近交系(recombinant intervalmapping，CIM)[2]，后者因其具有较优 良 inbredlines，RIL)群体 (或 回交BC(backcross)群 的统计学特点，目前被广泛应用 ．然而，无论是IM 体)的AA(或Aa)，aa分别赋值 1，一1(或者一1， 还是CIM，都忽略了上位性，当QTL间存在上位性 1)，并将此赋值用X。表示；而标记基因型赋值的复 时，其结果都是有偏的 ]．针对复合区间作图等作 合采用数学上的 “乘积”方式(相乘式)．例如，两个 图方法忽略 QTL上位性效应的这一缺点，本文首 标记座位时，AABB可赋值 1×1—1，AABb可赋值 先提出了分子标记的遗传编码及其复合原则，并据 1×O一0，AAbb可赋值 1×(一1)一一1等等，此类 此定义了标记变量与复合标记变量，采用统计学与 复合赋值用X。表示；同理，还可以有 X。，…，X。等 数量遗传学的基本原理，对此进行了有关的理论探 复合赋值 ． 讨，进而提出了关于CIM等作图方法在QTL互作 1．2 标记变量及复合标记变量之间的关系 效应存在时的改进方案 ． 将上述X。称为标记变量，而将X。，X。，…，X。 均称为复合标记变量 ．那么，可以证明(证略)，各类 1 原 理 标记变量之间的协方差具有如下关系： f1—2rf， BC、DH(及 RIL) 1．1 分子标记的遗传编码及其复合原则 0X i“lD(一12(1—2rli)F2 u 分子标记的遗传编码 (或赋值)，可能有多种方 xI(f)x_()= x】(f)x。(m)= …=0 (2) 式，例如，对于F。群体一个标记位点的AA，Aa，aa 而言，可以赋值 3，2，1，或者2，1，0，也可以赋值 1， OX_(il)X_()