第五章 PubMed.ppt

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第五章 PubMed

作业 A 中国学术期刊CNKI、维普中文科技期刊数据库分别查找以下文献,写出检索式,并比较检索结果。 1、查找同济大学生命科学与技术学院丁祖泉教授撰写的文献 2、查找丁祖泉教授撰写的且“肱骨三维模型”在题名中出现的文献 B 利用万方数据库检索帕金森病与氧化有关的学位论文,要求学生专业为“神经”专业,并下载一篇博士论文中、英文摘要。 答案 检索式 作者=丁祖泉 and 机构=同济大学生命科学与技术学院 题名=肱骨三维模型 and 作者=丁祖泉 利用万方数据库检索帕金森病与氧化有关的学位论文,要求学生专业为“神经”专业,并下载一篇博士论文中、英文摘要 前方一致与精确检索的区别 PubMed 网上免费MEDLINE PubMED PubMed基本介绍 PubMed检索 练习 作业 PubMed基本介绍 数据库简介 PubMed是美国国立医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)建立的生物医学文献检索系统; 1988年,美国参议员Claude Pepper发起,1988年11月4日,通过立法建立国立生物技术信息中心(NCBI),其任务是建立基于计算机信息处理的关于分子生物学、生物化学、遗传学知识的存储和分析的自动系统。并进行先进方法的研究,促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用,促进全世界范围内的生物技术信息收集的合作。 NCBI创建了生物医学领域中最著名的信息检索系统ENTREZ系统,该系统通过数据间的相关联系,实现了不同数据库间的自由转换,允许用户从NCBI整合的多个数据库中同时检索文献题录和分子生物学数据。 NCBI生物医学检索系统(Entrez) PubMed:生物医学文献数据库; Nucleotide:核苷酸序列数据库; Protein:蛋白质序列数据库; Genome:完整的基因组汇编; Structure:大分子三维结构; PopSet:人口研究数据集; Taxonomy:分类学数据库; OMNI:孟德尔人类遗传学数据库; Books:生物医学网络版图书; ProbeSet:基因表达和微阵列数据集; SNP:单核苷酸多肽性数据库; PubMed收录范围 MEDLINE: 即Medline光盘数据库的内容,收录4600余种生物医学期刊,内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科。这些期刊来源于美国和世界上70多个国家和地区。 文献量达1千1百万条记录,并回溯到1966年。 [PubMed—indexed for MEDLINE] PreMEDLINE:处于加工阶段的文献记录,提供基本的书目数据,但尚未标引主题。每天增加新记录,每周一次转入到MEDLINE。 [PubMed—in process] 出版商提供的文献数据(Publisher Supplied Citations):收录出版商直接向PubMed递送的电子记录,其中的大多数最终经过标引要增加到Medline中。 [PubMed—as supplied by publisher]。 历史与背景 INDEX MEDCUS MEDLARS ONLINE MEDLINE CD MEDLINE WEB PubMed 与MEDLINE的区别 收录范围广:MEDLINE收录的部分生命科学相关文章的非医学专业期刊(物理、天文、化学等); 收录记录新:在MEDLINE数据标引前的必威体育精装版题录 文献类型全:提供电子原文链接(部分免费) PubMed检索 一般检索 PubMed 限定检索功能 Preview/index(检索策略预览) 浏览检索式 改变检索式 (可用检索式编号#1 AND #2) 浏览索引(index) Preview/index(检索策略预览) History(检索史) 检索式回顾 编辑检索式 如:#1 AND #2 Details匹配过程 显示检索词转换匹配运算详细过程 用途:转换确定规范词 如:liver cancer →liver neoplasms 修改检索策略 自动转换检索词(automatic term mapping) 自动对照规范词表,期刊名表,短语,著者名索引, 依次寻找转换; 短语寻找转换,改成单词转换; 单词在上述四个字段寻找转换,在所有字段中转换 如:输入cd44系统转换为cd44 antigens[Text Word] OR antigens, cd44[MeSH Terms] OR cd44[Text Word] 主题词检索 主题词检索 确定规范检索词 查看词义注释、树状结构表

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