Clustalx+多重序列比对图解教程.pdf

Clustalx 多重序列比对图解教程(By Raindy) 本人原创教程，转载请保留作者信息，谢谢！ 软件简介 ： CLUSTALX－是 CLUSTAL 多重序列比对程序的 Windows 版本。Clustal X 为进行多重序列和轮廓比 对和分析结果提供一个整体的环境。 序列将显示屏幕的窗口中。采用多色彩的模式可以在比对中加亮保守区的特征。窗口上面的下拉菜单 可让你选择传统多重比对和轮廓比对需要的所有选项。 主要功能 ： 你可以剪切、粘贴序列以更改比对的顺序； 息 你可以选择序列子集进行比对； 你可以选择比对的子排列(Sub-range)进行重新比对并可插入到原始比对中； 信 可执行比对质量分析，低分值片段或异常残基将以高亮显示。 当前版本:2.0 者 PS：如果你是新手或喜欢中文界面，推荐使用本人汉化的 Clustalx 1.81 版 链接地址： 作 /index.php?Go=Show ListID=7435 (请完整复制) 应用 ：Clustalx 比对结果是构建系统发育树的前提 留 实例 ：植物呼肠孤病毒属外层衣壳蛋白 P8(AA 序列)为例 流程 ：载入序列―编辑序列―设置参数―完全比对―比对结果 保 1.载入序列 ：运行 ClustalX，主界面窗口如下所图（图 1），依次在程序上方的菜单栏选择“File”－ “Load Sequence”载入待比对的序列，如图 2 所示，如果当前已载入序列，此时会提示是否替换现有序 请 列(Replace existing sequences)，根据具体情形选择操作。 载 转 程， 教 创 原 图 1 息 信 者 作 留 图 2 保 请 载 转 程， 教 创 原 图 3 2.编辑序列 ：对标尺(Ruler)上方的序列进行编辑操作，主要有