工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群多样性及菌群结构分析.pdfVIP

第38卷第3期 家畜生态学报 V01．38NO．3 Acta Animalis 2017年3月 Ecologiae Domastici Mar．2017 工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群多样性及菌群结构分析 宋 冰，任战军+，宫瑞光，孟繁臣 (西北农林科技大学动物科技学院，陕西杨凌712100) [摘要]论文旨在分析工厂兔、散养兔和野兔的盲肠茵群多样性及茵群结构。收集工厂兔、 散养兔和野兔各6只并采集盲肠内容物，提取盲肠内容物基因组DNA并对16SrDNA的V4一 V5区进行HiSeq测序。结果表明：(1)工厂兔盲肠细菌种类数、盲肠菌群丰富度、盲肠菌群多 样性指数均显著(PO．05)高于散养兔和野兔。(2)工厂兔、散养兔和野兔盲肠茵群结构相互 之间差异显著(P0．05)。(3)工厂兔、散养兔和野兔盲肠茵群的主要菌门为厚壁茵门(工厂 30．8％，野兔为21．21％)，野兔的特殊优势茵门为螺旋体门(12．36％)。工厂兔、散养兔和野 兔盲肠茵群的主要菌科均舍瘤胃菌科(工厂兔为39．26％，散养兔为33．33％，野兔为 势茵科为理研茵科(19．75％)，野兔的特殊优势菌科为螺旋体科(12．36％)。在属水平上，工厂 0．05)，但主要茵门均为厚壁菌门和拟杆菌门；工厂兔盲肠菌群多样性高于散养兔和野兔。 [关键词]肉兔；野兔；盲肠；茵群多样性；茵群结构 [中图分类号]$811．5 [文献标识码]A [文章编号] cuniculus)和草原野兔 伊拉肉兔(Oryctolagus 1材料与方法 (Lepuscapensis)消化生理特征存在差异，但二者均 为盲肠发酵的草食动物，盲肠内包含多种多样的细 1．1试验动物和分组 菌，明确盲肠菌群种类对进一步深入研究兔肠道菌 于2016年8月10日收集健康成年的工厂养殖 群健康具有重要意义。已有研究结果表明，野兔的 伊拉肉兔、家庭散养伊拉肉兔、草原野兔各6只，分 胃和盲肠相对于体重的比例与家兔相比显著较小， 别来自陕西省渭南市澄城县某兔场、陕西省宝鸡市 肠道食物通过率显著较快，半纤维素消化能力显著 岐山县红星村、陕西西安市郊区。本试验分工厂兔、 散养兔和野兔三组，每组6个重复。将试验兔放进 较低[1]。Mista等[2]报道野兔盲肠发酵模式与家 兔相比表现为较少量的甲烷和挥发性脂肪酸及较高 干净的可透气的木箱中运输，到达实验室后立即屠 产量的丙酸和异丁酸，表明了二者盲肠菌群存在差 宰，采集盲肠内容物，装入2mL离心管，放一20℃ 异。Abecia等[31报道的不同环境和饮食条件下的储存。肠道样品采集均在西北农林科技大学动物科 家兔和野兔盲肠内寄居着明显不同的细菌群，但未 学院养兔与经济动物实验室进行。工厂兔日粮组成 明确指出细菌种类。目前暂无关于野兔盲肠菌群多 及营养水平(Ixl干基础)见表1。散养兔采食麸皮豆 样性及菌群结构的研究。本试验运用HiSeq测序渣(比例为3～4：1)和鲜草。将麸皮豆渣和鲜草烘 技术分析工厂兔、散养兔和野兔的盲肠菌群多样性 干后，以1：1混合测定主要营养物质含量得，能量 及菌群结构。 *[收稿日期]2017—02—27修回日期：2017—03—01 [基金项目]家兔肉用性状功能基因解析(K3310216062)；伊高乐兔工厂化繁育技术(K3360216012) *[通讯作者]任战军(1966一)，男，陕西淳化入，副教授，硕士生导师，主要从事特种经济动物营养调控研究。