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08蛋白质代谢要点
* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 有一个例外:真核生物线粒体DNA 一些原核生物中利用终止密码翻译AA(UGA-Trp\硒代半胱氨酸) * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 丝氨酸 -------- 乙醇胺 ---------- 胆碱 ----------- 卵磷脂 色氨酸 --------- 吲哚丙酮酸 --------- 吲哚乙醛--------- 吲哚乙酸 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 现在已经知道作为多肽合成起始信号的密码子有两个,即甲硫氨 酸的密码子(AUG)和缬氨酸的密码子(GUG)(极少出现) 在大肠杆菌中, 起始密码子AUG 所编码的氨基酸并不是甲硫氨酸本 身, 而是甲酰甲硫氨酸。 fMet-tRNAf的形成 Met-tRNAf + N10-甲酰FH4 fMet-tRNAf + FH4 甲酰化酶 fMet-tRNAifMet 细胞内有两种携带甲硫氨酸的tRNA: tRNAf--用来与fMet相结合,参与肽链合成的起始作用 tRNAm--携带正常的甲硫氨酸掺入肽链 30S复合物形成: AUG IF3 IF3 AUG IF3 GTP、IF1、 IF2 fMet-tRNAf 小亚基 AUG GTP、IF1、IF2 fMet UAC 5? 真核生物: Met-tRNAMet--真核生物无甲基化过程,起始氨基酸是Met,起始tRNA为Met-tRNAMet 2)70S起始复合物的形成 在肽链合成起始时,首先是核糖体小亚基与mRNA上的核糖体结合位点识别结 合,然后,大亚基与小亚基结合,形成完整的核糖体(70S起始复合物)。 f f 30S起始复合物(30S核糖体-mRNA-fMet-tRNAf) 再与50S亚基相结合,形成有生物学功能的70S起始复合物,同时GTP水解成GDP和Pi,IF1、IF2被释出。这时f-Met-tRNAf占据了核糖体上的肽酰位点(P位点),空着的氨酰-tRNA位点(A位点)准备接受另一个氨酰-tRNA,为肽链延伸作好准备 在70S起始复合物中,tRNAf上的反密码子一定要与mRNA上的起始密码子AUG(GUG)配对,以保证读码准确无误 70S复合物的形成: AUG GTP、IF1、IF2 fMet UAC 5? + 50S核糖体 AUG GTP、IF1、IF2 fMet UAC 5? P位点 A位点 GDP+Pi、IF1、IF2 3、肽链的延伸 进位(一个新进入的氨酰-tRNA结合到7OS核糖体的A位点上) 新的氨酰- tRNA进入A位需要消耗GTP 需EF-Tu(热不稳定) EF-Ts(热稳定)两种延伸因子 EFTu先与GTP结合,再与氨酰- tRNA结合,形成一个复合物,再与70S起始复合物相结合,并释出EFTu-GDP EFTu-GDP再与EFTs及GTP反应,重新形成EFTu-GTP,并参与下一轮反应 所有氨酰-tRNA必须与EF-Tu-GTP结合才可进入70S核糖体 除了fMet-tRNAf f 转肽 在肽酰转移酶的作用下P位点上fMet-tRNAf的甲酰甲硫氨酸从相应的tRNA上解离下来,其-COOH与刚进入A位的氨酰-tRNA上的-NH2形成肽键(实质是A位点氨酰-tRNA氨基亲核攻击酯键羰基),无负荷的tRNA留在P位,此时A位点携带一个二肽。 5’ 3’ P A AA-fMet AA A P fMet 5’ 3’ 移位 在EF-G(移位酶)的作用下,核糖体沿mRNA5’? 3’方向移动,每次移动一个密码子的距离,结果使原来在A上的肽酰-tRNA移到了P位点,原来在P位点的无负载的tRNA离开核糖体,同时一个新的密码子进入空的A位, EF-G 催化的移位过程需水解GTP提供能量 肽链合成从N-C 5’ 3’ P A 5’ 3’ P A A P 以上三步为一个延伸循环,肽链每掺入一个氨基酸就重复一次延伸循环。 肽链合成从N-C 4、肽链合成的终止与释放 肽链合成的终止包括两步: 对mRNA上终止信号(UAA,UAG,UGA)识别; 完工的肽酰-tRNA酯键水解,使新合成的肽键释放出来 三种蛋白因子参与这一步: RFl:识别密码子UAA、UAG RF2:识别UAA,UAG RF3:不识别任何终止密码子,
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