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大肠杆菌染色体 DNA的结构域 基因组超螺旋 DNA结合蛋白 * 原核生物的分为哪几类? 原核生物和真核生物的差异主要有什么? 导致以上差异(进化)的根本原因是什么? 原核生物(Prokaryota)是一些由无真正的细胞核的细胞组成的单细胞或多细胞的低等生物,相对于真核生物(Eukaryota)而言。包括古细菌(Archaea)和细菌(Bacteria)(其中包含支原体和蓝藻门)。 一般沒有细胞內膜,沒有细胞核膜,无真正的细胞核,但依然有遗传物质,如:DNA、RNA……。原核生物的DNA伴随些许蛋白质,以一个或数个环形分子的方式存在一起。 原核细胞有核糖体,可能有中心体,无其它细胞器,真核细胞则有。 原核细胞细胞分裂方式为细胞分裂,真核細胞細胞分裂是「有丝及减数分裂」。 原核細胞遗传形式是 DNA分子与少数释出的蛋白质結合,真核細胞是染色体的DNA与蛋白质結合。 大肠杆菌染色体 DNA的结构域 基因组超螺旋 DNA结合蛋白 E.Coli染色体由长度为4.6Mb的单一闭环DNA分子为主。其中DNA再与蛋白质结合,如聚合酶、抑制物和其他成分等 体外分离出来的压缩小体DNA,根据它对溴乙锭的反应可以判定它是闭合的双链体结构。 溴乙锭能够插入碱基对之间,之后由负超螺旋(?Lk/Lk。=-0.06)变成正超螺旋而形成闭环DNA分子,也就是双链均共价整合的DNA分子(在一条链上有一个切口的开环DNA分子,或是线性的DNA分子在溴乙锭插入后可以自由旋转,这样就减轻了张力。) 每一个结构域就是一个DNA环 每一个基因组约有100个这样的结构域 每一个结构域约有40kb(50-100kb)长的DNA组成的紧密的纤丝结构 基因组中的超螺旋能够以两种基本的形式存在: 1.如果超螺旋DNA是游离的…… (又可以分为两种情况1,2) 2.如果蛋白质与DNA结合使其保持特定的三维构象,超螺旋被限制…… 实验证明DNA扭转张力 DNA结合蛋白的定义: 1.与周围DNA发生非特异形结合, 2.约束着约半数的DNA超螺旋 包括HU蛋白以及H-NS蛋白(H1蛋白,类组蛋白histone-like protein) 能够浓缩DNA的二聚体,能够将DNA裹成一个念珠结构。如果其亚基hupA,hupB都失去功能,那么DNA的一些超螺旋也会消失。 1.一种中性的单体蛋白 2.倾向与DNA内部弯曲区域发生非特异结合 3.具有压缩DNA的作用,对DNA被包装进入类核以及稳定和限制染色体超螺旋十分必要 4.亦称类组蛋白 染色体上的蛋白质包括组蛋白和非组蛋白。 1. 组蛋白 组蛋白是染色体的结构蛋白,它与DNA组成核小体。通常可以用2mol/L NaCl或0.25mol/L的HCl/H2SO4处理使组蛋白与DNA分开。 组蛋白分为H1、H2A、H2B、H3 及 H4。 组蛋白分为H1、H2A、H2B、H3及H4。这些组蛋白都含有大量的赖氨酸和精氨酸,其中H3、H4富含精氨酸,H1富含赖氨酸;H2A、H2B介于两者之间。 进化上的极端保守性。 无组织特异性。 肽链上氨基酸分布的不对称性。 组蛋白的修饰作用。 富含赖氨酸的组蛋白H5。 非组蛋白的一般特性: 非组蛋白的多样性。非组蛋白的量大约是组蛋白的60%~70%,但它的种类却很多,约在20-100种之间,其中常见的有15-20种。 非组蛋白的组织专一性和种属专一性。 2. 非组蛋白 HMG蛋白(high mobility group protein)。这是一类能用低盐(0.35mol/L NaCl)溶液抽提、能溶于2%的三氯乙酸、相对分子质量较低的非组蛋白,相对分子质量都在3.0×104以下。 DNA结合蛋白。用2mol/L NaCl除去全部组蛋白和70%非组蛋白后,还有一部分蛋白必须用2mol/L NaCl和5mol/L尿素才能与DNA解离。这些蛋白分子量较低,约占非组蛋白的20%,染色质的8%。 A24非组蛋白。 *
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