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Pajek数据格式和图像的输出保存
Pajek 数据格式和图像的输出保存
本文举例所用源代码:链接: /s/1jGAhmZ0 密码: i6fe
一 pajek 的数据格式
参考:http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/此处有Start with Pajek 的PDF
1 Networks 网络的表示方式:
参考:pajek-Program for Analysis Visualization of Large Networks[M],P77 P89
pajek-分析和可视化大型网络的程序[M],P4 P52-56
pajek 中使用arcs 弧表示有向边,edges 边表示无向边。
(1)点边式
文件后缀.net
文件中间隔为空格
#点的规定
节点编号 标签 位置坐标(0≤x 、y 、z ≤1,2D 中Z==0.5 ) 节点形状 ic 节点颜色
其中,节点编号是必选项,标签可由软件自动生成数字序列标签。该文件中节点形状的
大小只能通过x_fact 10 y_fact 10 这种方法设置,比较麻烦。另外可考虑通过设置Vectors
表的值来改变。
#边的规定
边的起点 终点 边的权值 c 表示边的颜色(注:节点的值在Vector 文件中)
其中,起点、终点、边权值是必选项,(边权值可自动生成?)
#点边式实例 testAE.net
*Vertices 3
1 SanJiao 0.2 0.7 0.5 triangle ic LightYellow
2 FangXing 0.2 0.2 0.5 box ic LightCyan
3 LingXing 0.7 0.2 0.5 diamond ic LightGreen
*Edges
1 2 1 c Red
2 3 1 c Blue
1 3 1 c Yellow
(2)点边序列式
文件后缀.net
点的方式与点边式文件中点的表示方式一样,边是将与节点有连接的点无重复列出,注
意此处省略了边的值。
实例 testALEL.net
*Vertices 3
1 SanJiao 0.2 0.7 0.5 triangle ic LightYellow
2 FangXing 0.2 0.2 0.5 box ic LightCyan
3 LingXing 0.7 0.2 0.5 diamond ic LightGreen
*Edgeslist
1 2 3
2 3
保存格式中还有个
是将节点的属性忽略了:testALEL
(3)点矩阵式
边使用邻接矩阵的形式表示,简单无向图的邻接矩阵是对称矩阵。(图论中还有另外两种
使用矩阵表示图的方法:关联矩阵和可达矩阵。图论及其运用P49 )
文件后缀.mat 有Binary 和Valued 两种类型,Binary 类型的矩阵简洁,矩阵数字无小数
点。Valued 类型有小数点。
Binary 类型的testBM.mat
Valued 类型的testVM.mat
(4) UCINET DL 格式
实例:testUCDL.dat
2 Partitions 分类的表示方式:
参考:
http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/SignedNetworks/SignedNetworks.htm
http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/SignedNetworks/SampsonT4.paj
http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/SignedNetworks/UsingConstraints.pdf
文件后缀 .clu
实例:test.clu
该列数字表示对应节点所属的类的编号(类的编号可从0 开始),图中表示节点1 属于编
号为1 的类,节点2 和节点3 同属于编号为2 的类。
3 Vectors 向量的表示方式:
为节点赋予相关的史书数值,如表示节点大小的值,节点的度等。
参考pajek 复杂网络仿真平台[M],P9-10
文件后缀 .vec
实例:test.vec
该列表示分别赋予节点1/2/3 的值为1/3/2。
4 Permutations 排序、Cluster 类和Hierarchies 层次的表示方式
文件后缀分别为.per .cls .hie,详见:pajek-分析和可视化大型网络的程序[M],P4 P52-56
pajek 复杂网络仿真平台
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