ChemOffice_2008_实用教程.pdf

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ChemOffice_2008_实用教程

ChemOffice2008实用教程 ——化学结构绘图 分子模拟 数据整合 主编:曾炜、孙延辉、李红霞 时间:2009年8月 目录 1. ChemOffice基础知识 2. ChemDraw操作基础 3. Chem3D操作基础 4. ChemFinder操作基础 1 1. ChemOffice基础知识 1.1 ChemOffice2008 简介 1.2 ChemOffice 2008 的模块 1.3 ChemOffice 2008 的安装与启动 1.4 其他绘图软件 2 1.1 ChemOffice2008简介 图1-1 ChemOffice发展历史 3 1.2 ChemOffice2008模块 ChemDraw:化学结构绘图(Chemical Structure Drawing Standard ) Chem3D:分子模拟分析绘图(Molecular Modeling and Analysis) ChemFinder:化学信息搜寻整合系统(Searching Information Integration) 4 1.2.1 ChemDraw模块组件 • AutoNom:是Beilsteiny最强的软件,现已包含于ChemDraw Ultra 中,它可按照IUPAC的标准自动命名化学结构。 • ChemNMR:预测13 1 C和 H-NMR谱图,节省实验费用。 • ChemProp:预测沸点(BP)、熔点(MP)、临界温度(Tc )、 临界气压(CP )、吉布斯自由能(G)、logP、折射率(n)、热 结构(HF)等性质。 • ChemSpec:提示用户输入JCAMP及SPC频谱数据,以比较 ChemNMR预测的结果。 • ClipArt:高质量的实验室玻璃仪器图库,用于搭配ChemDraw使用。 • NameStruct:输入IUPAC化学名称后可自动生成ChemDraw结 构。 5 1.2.2 Chem3D模块组件 •Excel Add-on:与微软的Excel完全整合,并可与ChemFinder联合使用。 •Gaussian Client:量子化学计算软件Gaussian 03W的客户端接口,可直接在 Chem3D中运行Gaussian,并提供数种坐标格式(需要安装Gaussian 03W )。 Gaussian是做半经验计算和从头计算时使用最广泛的量子化学软件,可以研究分 子能量和结构、过渡态的能量和结构、化学键、反应能量、分子轨道、偶极矩和多 极矩、原子电荷和电势、振动频率、红外和拉曼光谱、NMR、极化率和超极化率、 热力学性质以及反应路径等。计算可以模拟在气相和溶液中的体系,模拟基态和激 发态。Gaussian 03还可以对周期边界体系进行计算。Gaussian是研究取代效应、 反应机理、势能面和激发态能量的有力工具(需另外获得GAMESS)

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