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mimics中文版教程(持续更新版0812)
第二章 Mimi
本教程的第二个例子中,我们将为你展示Mimics 的一些基本功能,所要讨论的主题如下:
打开工程Opening the Project
窗口化 Windowing
二值化 Thresholding
区域增长 Region Growing
建立3D 表示 Creating a 3D representation
显示3D 表示 Displaying a 3D representation
STL+过程 STL+ Procedures
生成STL 文件 Generating a STL file
RP 分层过程 RP Slice procedures
生成一个轮廓文件 Generating a contour file
生成支持文件 Generating supports
结果视图 View of the end result
1.打开工程
在文件菜单栏中,选择打开工程选项(或者直接用快捷键 Ctrl+O ),打开对话框中将显示工
作目录中所有工程,双击打开mimi.mcs 文件。
所有的图片都被打开并显示在三个视图中,右边视图是轴视图 (xy-view 或者axial view ),左
侧上面的视图是前视图 (xz-view 或者coronal view ),左侧下面的视图是侧视图 (yz-view 或
者sagittal view )。不同颜色的交叉线代表了每个视图的等高线(contour lines ),每条指示线
能够标记相关视图的切片。你可以在任意视图的CT 图片的任意位置直接用鼠标点击你想要
操作的位置,交叉线的位置将会到达你所点的位置,所有试图将更新显示为相关的切片。
如果视图中有些方位标记有错需要修改,在File Change Orientation 中打开窗口你可以通
过右键鼠标选择正确的方位。
在菜单栏View Indicators 中可以选择分别关闭刻度线(Trick Marks )、交叉线(Intersection
Lines)、分片位置(Slice Position )、方位字符(Orientation strings )指示器。
窗口右侧的滚动条可以用来转动视图中的图片。
在当前工程中(Mimi),所有的视图是正确的。如果你想在图片集中除去某些不合适的图片,
用教程案例1 中的方法,在File Organize Images 中进行操作。
2. 窗口化
首先,我们必须把不同视图中的图片对比度调整到一个合适的值。对比度的增强,有助于选
择不同密度的部分,例如骨头和脑肿瘤,这个操作可以在任何时候做。
可以在工程管理器的对比度标签中改变之
对比度标签显示了工程的直方图,并且用一条线代表了“窗口”,灰度值或者 HU 值低于这
条线的起点值的地方将会显示为黑色,所有灰度值在这条线终点值之上的将显示为白色,灰
度值在窗口值之间的地方将显示为渐变的灰色。
你可以单击鼠标左键拖动“窗口线”到想要的位置来改变“窗口”的大小,要想移动“窗口”,
选择那条线并拖动到新的位置即可。
你也可以在标签底部选择预先定义好的窗口。
下面将描述想要获得一个好的分片掩膜需要进行的步骤。一个分片掩膜是你所感兴趣的像素
所组成的一个你可以进行处理的对象。一般可以建立多个独立的或者不独立的掩膜,不同的
掩膜用不同的颜色标记。通常要获得最终的掩膜可能需要几个不同的掩膜来相互操作而得
到。
3. Thresholding 二值化
二值化保留分割对象的图片中灰度值大于或等于阈值的像素,有时需要定义阈值的上界和下
界,分割掩膜将保留所有灰度值在上下界之间的像素。
例如,比较小的阈值选择病人的软组织比较容易,阈值比较大则只会保留比较稠密的部分。
定义上界和下界阈值选择神经部分就比较容易。如何定义一个好的阈值取决于建模的目的,
如果你想要一个好看的模型,建议使用比较小的阈值,因为这样建出的模型洞比较少;相反,
如果是为了建立义肢的模型服务的话就推荐使用比较大的阈值。
单击Threshold 按钮 。
通过Threshold Toolbar 的滑动条来改变阈值
选择一个合适的阈值的窍门:
看不同的图片,你可以改变图片:
使用arrow,page up 和page down
使用窗口右边的滑动条
移动切片指示器
单击Profile 按钮
在轴视图中穿过骨头画一条线:在软组织地方单击鼠标左键来标记起始点,拖动鼠标穿过骨
头后单击,这样沿着这条线就产生一个强度截面,这
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