Module2定量PCR实验设计和流程.PDFVIP

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Module2定量PCR实验设计和流程

Module 2: 定量PCR实验设计和流程 The world leader in serving science 1 定量PCR的实验设计 • 准确定量样品的三个基本要求 • 定量PCR的实验要素 • 定量PCR的实验中的误差校正 2 准确定量样品的三个基本要求 •重复性好 •准确度高 •动力学范围宽 3 1. 重复性: 曲线一致性 重复性好 40个相同样本重复 4 2. 准确度 与正确检测数据的接近程度 5 3.动力学范围 能得到高质量数据的线性范围 (范围越大越好) 6 定量PCR的实验要素  目的基因 样品  标准曲线 标准品  监控系统 阳性对照  监控污染 阴性对照 7 目的基因: 样品 模板质量:纯度和浓度 分光光度计检测: – DNA纯度:OD260/OD280=1.8 – RNA纯度:OD260/OD280=2.0 Qubit® 荧光定量: – 分别定量DNA、RNA及蛋白质 – 准确性、灵敏度和简便性 – Qubit® Assay (dsDNA, ssDNA, RNA, protein) 8 标准曲线:标准品  目的:生成标准曲线,建立Ct值与浓度之间的线性关系  要求: – 绝对定量实验:标准品浓度已知 – 相对定量实验:标准品与待测样品的PCR效率一致,且接近 100% • 试剂质量一致:模板纯度、引物和探针的Tm值、酶活性、缓 冲液成分 • 反应条件一致:循环参数相同 9 标准曲线:如何制备标准曲线 • Don’t: • 制备3个点的2倍标准曲线 • Do: • 推荐制备至少5个点的10倍标准曲线 (4 logs) 10 标准曲线:标准品梯度稀释方法  10倍连续梯度稀释方法: 1v原液(标

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