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GCBI文献查询与基因分析课案
GCBI文献查询与基因分析;文献查询:/pubmed/
基因查询:/gene/
miRNA查询:/
lncRNA查询:/
样本查询:/gds/
IF查询:/sciif.asp
综合查询:/
;论文举例;成文思路;确定方向;文献查询;查询关键词
Dendritic Cell differentiation and function
lncRNA
STAT3
RNAi
Chip-seq
RNA pulldown
获取相关文献及基因信息,整理科研思路
;文献查询;文献查询;文献查询;关注文献中的样本处理;关注文献中的样本处理;关注文献中的样本处理;关注文献中的样本处理;关注文献中的样本处理;GC-Lab ?;GC-Lab 数据处理中心;创建个人实验室、加入别人实验室;样本:nine human immune cell subsets (neutrophils, eosinophils, monocytes, B cells, NK cells, CD4 T cells, CD8 T cells, mDCs and pDCs)
目的:identify cell-type specific mRNA
检测平??:Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array;GC-Lab 分析思路设计;GC-Lab 分析思路设计;差异及聚类结果;GC-Lab 分析思路设计;GC-Lab 本地数据上传;实验数据;高通量检测
14个样本HTA 2.0芯片
2个样本RNA-seq
检测数据都做了些什么?;数据利用;Monocytes经过6个时间点分化为Dendritic Cell
HTA 2.0 芯片检测,获得mRNA、lncRNA表达数据
可分析mRNA、lncRNA随分化时间而发生表达变化的趋势
对mRNA进行GO、Pathway分析
分析lncRNA调控mRNA的共表达网络,找到核心调控lncRNA和mRNA;实验室折腾方案;GC-Lab 图形展示结果;GC-Lab 可下载的分析结果;GC-Lab 可下载的分析结果;核心基因 FOSB;对FOSB在免疫方面的研究就三篇文献;查询FOSB基因信息;对FOSB研究,后续可以做点什么?;祝您实验顺利
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