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GCBI文献查询与基因分析.pptx

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GCBI文献查询与基因分析课案

GCBI 文献查询与基因分析;文献查询:/pubmed/ 基因查询:/gene/ miRNA查询:/ lncRNA查询:/ 样本查询:/gds/ IF查询:/sciif.asp 综合查询:/ ;论文举例;成文思路;确定方向;文献查询;查询关键词 Dendritic Cell differentiation and function lncRNA STAT3 RNAi Chip-seq RNA pulldown 获取相关文献及基因信息,整理科研思路 ;文献查询;文献查询;文献查询;关注文献中的样本处理;关注文献中的样本处理;关注文献中的样本处理;关注文献中的样本处理;关注文献中的样本处理;GC-Lab ?;GC-Lab 数据处理中心;创建个人实验室、加入别人实验室;样本:nine human immune cell subsets (neutrophils, eosinophils, monocytes, B cells, NK cells, CD4 T cells, CD8 T cells, mDCs and pDCs) 目的:identify cell-type specific mRNA 检测平??:Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array;GC-Lab 分析思路设计;GC-Lab 分析思路设计;差异及聚类结果;GC-Lab 分析思路设计;GC-Lab 本地数据上传;实验数据;高通量检测 14个样本HTA 2.0芯片 2个样本RNA-seq 检测数据都做了些什么?;数据利用;Monocytes经过6个时间点分化为Dendritic Cell HTA 2.0 芯片检测,获得mRNA、lncRNA表达数据 可分析mRNA、lncRNA随分化时间而发生表达变化的趋势 对mRNA进行GO、Pathway分析 分析lncRNA调控mRNA的共表达网络,找到核心调控lncRNA和mRNA;实验室折腾方案;GC-Lab 图形展示结果;GC-Lab 可下载的分析结果;GC-Lab 可下载的分析结果;核心基因 FOSB;对FOSB在免疫方面的研究就三篇文献;查询FOSB基因信息;对FOSB研究,后续可以做点什么?;祝您实验顺利

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